RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558943.5

SPG21-208, Transcript of SPG21, maspardin, human

TSL 4

Gene SPG21, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPG21-208	ENST00000558943	CYP4F2	P78329	520 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	ENPP2	Q13822	863 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	ZNF234	Q14588	700 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	CLCA4	Q14CN2	919 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	TGIF1	Q15583	401 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	NPY5R	Q15761	445 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	ZNF276	Q8N554	614 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	GOLGA1	Q92805	767 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	SERAC1	Q96JX3	654 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	ZNF560	Q96MR9	790 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	ASB7	Q9H672	318 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	PLK2	Q9NYY3	685 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	C2CD2	Q9Y426	696 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	LRBA	P50851	2863 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	ARID2	Q68CP9	1835 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	ITPR2	Q14571	2701 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943		A0A1W2PR77	199 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	NEMP2	A6NFY4	417 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943		F8VP50	259 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	DVL2	O14641	736 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	FFAR2	O15552	330 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	ATP2C2	O75185	946 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	DDAH2	O95865	285 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	IGHD	P01880	384 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	ADRB2	P07550	413 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	ITGA2B	P08514	1039 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	CPA1	P15085	419 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	MUT	P22033	750 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	PRKCH	P24723	683 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	SLC5A2	P31639	672 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	GALC	P54803	685 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	MFAP3	P55082	362 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	RPS14	P62263	151 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	COL10A1	Q03692	680 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	STAT4	Q14765	748 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	GEN1	Q17RS7	908 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	FAM171B	Q6P995	826 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	NUP93	Q8N1F7	819 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	SLC25A45	Q8N413	288 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	OR4C6	Q8NH72	309 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	ST8SIA2	Q92186	375 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	FBXO32	Q969P5	355 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	MYLPF	Q96A32	169 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	MIB2	Q96AX9	1013 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	ARRDC3	Q96B67	414 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	C8orf48	Q96LL4	319 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	AIFM3	Q96NN9	605 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	PKMYT1	Q99640	499 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	USP29	Q9HBJ7	922 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	L1RE1	Q9UN81	338 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	DNM3	Q9UQ16	869 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	PTPRD	P23468	1912 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	FBN3	Q75N90	2809 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	TBC1D3D	A0A087WVF3	549 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	TBC1D3I	A0A087WXS9	549 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	TBC1D3E	A0A087X179	549 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943		A0A0B4J269	797 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	CPED1	A4D0V7	1026 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	TBC1D3L	B9A6J9	549 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	RTN2	O75298	545 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPG21-208	ENST00000558943	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62

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