RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555806.5

NEDD1-208, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 4

Gene NEDD1, Length 565 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-208ENST00000555806 MAML1Q92585 1016 aa18.46■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 GLMNQ92990 594 aa18.46■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 NUS1Q96E22 293 aa18.46■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 RNF157Q96PX1 679 aa18.46■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP18.46■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa18.46■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 SALL4Q9UJQ4 1053 aa18.46■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 INTUQ9ULD6 942 aa18.46■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 U3KQA8 63 aa18.46■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 CPED1A4D0V7 1026 aa18.45■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 LMO7DNF2Z398 122 aa18.45■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 MT-CO3P00414 261 aa18.45■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 KRT1P04264 644 aa18.45■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 CTPS1P17812 591 aa18.45■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 GM2AP17900 193 aa18.45■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 SRP54P61011 504 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 DSC2Q02487 901 aa18.45■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 ARHGEF7Q14155 803 aa18.45■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 ELOCQ15369 112 aa18.45■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 NR0B2Q15466 257 aa18.45■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 CCDC13Q8IYE1 715 aa18.45■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 NDUFAF2Q8N183 169 aa18.45■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 NXPE2Q96DL1 559 aa18.45■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 TSGA13Q96PP4 275 aa18.45■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 CLPBQ9H078 707 aa18.45■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 ABCG4Q9H172 646 aa18.45■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 WDR26Q9H7D7 661 aa18.45■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 DTLQ9NZJ0 730 aa18.45■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa18.44■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 YY2O15391 372 aa18.44■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 SPOPO43791 374 aa18.44■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 OPA1O60313 960 aa18.44■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 TNFP01375 233 aa18.44■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 GP1BAP07359 652 aa18.44■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 ALPIP09923 528 aa18.44■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 KRT10P13645 584 aa18.44■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 CCNB1P14635 433 aa18.44■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 KELP23276 732 aa18.44■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 RPIAP49247 311 aa18.44■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 EPHB1P54762 984 aa18.44■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 KIAA1024LP59773 190 aa18.44■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa18.44■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 GUSBP11Q6P575 273 aa18.44■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 NYAP1Q6ZVC0 841 aa18.44■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 TC2NQ8N9U0 490 aa18.44■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 MAPK15Q8TD08 544 aa18.44■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 HDAC11Q96DB2 347 aa18.44■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 PDXPQ96GD0 296 aa18.44■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 COQ10AQ96MF6 247 aa18.44■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 DKK4Q9UBT3 224 aa18.44■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 AMACRQ9UHK6 382 aa18.44■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 HYOU1Q9Y4L1 999 aa18.44■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 HEY1Q9Y5J3 304 aa18.44■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 AK5Q9Y6K8 562 aa18.44■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 GOLGA6CA6NDK9 693 aa18.43■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 GOLGA6BA6NDN3 693 aa18.43■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 APOL1O14791 398 aa18.43■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 HLA-DQB2P05538 268 aa18.43■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 PDHA1P08559 390 aa18.43■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 GOLGA6DP0CG33 693 aa18.43■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 CA4P22748 312 aa18.43■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 LHCGRP22888 699 aa18.43■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 CES1P23141 567 aa18.43■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 ETV3P41162 512 aa18.43■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 SLC1A1P43005 524 aa18.43■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 MAGEA1P43355 309 aa18.43■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 NOP2P46087 812 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 PTPRRQ15256 657 aa18.43■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 ALG1LQ6GMV1 187 aa18.43■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 PNCKQ6P2M8 343 aa18.43■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa18.43■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 TSPAN33Q86UF1 283 aa18.43■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 GKN2Q86XP6 184 aa18.43■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 RFX6Q8HWS3 928 aa18.43■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 RHOT1Q8IXI2 618 aa18.43■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 SLC35F3Q8IY50 421 aa18.43■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 PLD5Q8N7P1 536 aa18.43■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa18.43■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 OR56A4Q8NGH8 313 aa18.43■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 TPCN2Q8NHX9 752 aa18.43■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 PIH1D2Q8WWB5 315 aa18.43■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 FATE1Q969F0 183 aa18.43■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 SCRN2Q96FV2 425 aa18.43■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 LGMNQ99538 433 aa18.43■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 BOCQ9BWV1 1114 aa18.43■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 KCTD5Q9NXV2 234 aa18.43■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa18.43■□□□□ 0.54
NEDD1-208ENST00000555806 MOSPD1Q9UJG1 213 aa18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms