RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

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Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 FERD3LQ96RJ6 166 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 TLE6Q9H808 572 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 KLQ9UEF7 1012 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 FBXO5Q9UKT4 447 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 KCNK1O00180 336 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 GABRDO14764 452 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 PEX1O43933 1283 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 MPZL2O60487 215 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
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PTPRB-208ENST00000550358 VARSP26640 1264 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
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PTPRB-208ENST00000550358 MC4RP32245 332 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 CXCR3P49682 368 aa8.52□□□□□ -1.05
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PTPRB-208ENST00000550358 MAPKAPK3Q16644 382 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF621Q6ZSS3 439 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
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PTPRB-208ENST00000550358 FEM1CQ96JP0 617 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 C1orf50Q9BV19 199 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 RNPEPQ9H4A4 650 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 IGFLR1Q9H665 355 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 ALG9Q9H6U8 611 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
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PTPRB-208ENST00000550358 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa8.52□□□□□ -1.05
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PTPRB-208ENST00000550358 MFN2O95140 757 aa8.52□□□□□ -1.05
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PTPRB-208ENST00000550358 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 UGT1A5P35504 534 aa8.52□□□□□ -1.05
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PTPRB-208ENST00000550358 XKR6Q5GH73 641 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 TCEAL5Q5H9L2 206 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 TRIQKQ629K1 86 aa8.52□□□□□ -1.05
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PTPRB-208ENST00000550358 KBTBD8Q8NFY9 601 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 AP3S1Q92572 193 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF711Q9Y462 761 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 GSAPA4D1B5 854 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 LRRC14BA6NHZ5 514 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 AP3D1O14617 1153 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 OR10H2O60403 315 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 AP2A1O95782 977 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP8.52□□□□□ -1.05
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PTPRB-208ENST00000550358 DOK6Q6PKX4 331 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 UNC5BQ8IZJ1 945 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 ABI3Q9P2A4 366 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF487B1APH4 448 aa8.51□□□□□ -1.05
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PTPRB-208ENST00000550358 BCL10O95999 233 aa8.51□□□□□ -1.05
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PTPRB-208ENST00000550358 S100GP29377 79 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 RPS6KA3P51812 740 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 AUHQ13825 339 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 ACAP2Q15057 778 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 PTPRNQ16849 979 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 FUT10Q6P4F1 479 aa8.51□□□□□ -1.05
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PTPRB-208ENST00000550358 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
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PTPRB-208ENST00000550358 E9PAM4 449 aa8.51□□□□□ -1.05
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PTPRB-208ENST00000550358 TNFSF9P41273 254 aa8.51□□□□□ -1.05
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PTPRB-208ENST00000550358 SULT1C3Q6IMI6 304 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 MZT2BQ6NZ67 158 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 FAM20CQ8IXL6 584 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 TEKT5Q96M29 485 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 MYLK2Q9H1R3 596 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 IGSF9Q9P2J2 1179 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa8.51□□□□□ -1.05
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