RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530628.2

CDKN2A-210, Transcript of cyclin dependent kinase inhibitor 2A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CDKN2A, Length 748 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2A-210ENST00000530628 PNLIPP16233 465 aa22.09■■□□□ 1.13
CDKN2A-210ENST00000530628 TRIM23P36406 574 aa22.09■■□□□ 1.13
CDKN2A-210ENST00000530628 ARHGEF7Q14155 803 aa22.09■■□□□ 1.13
CDKN2A-210ENST00000530628 ACOX1Q15067 660 aa22.09■■□□□ 1.13
CDKN2A-210ENST00000530628 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa22.09■■□□□ 1.13
CDKN2A-210ENST00000530628 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CDKN2A-210ENST00000530628 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa22.09■■□□□ 1.13
CDKN2A-210ENST00000530628 MED8Q96G25 268 aa22.09■■□□□ 1.13
CDKN2A-210ENST00000530628 TMEM168Q9H0V1 697 aa22.09■■□□□ 1.13
CDKN2A-210ENST00000530628 DPEP2Q9H4A9 486 aa22.09■■□□□ 1.13
CDKN2A-210ENST00000530628 CYP4F12Q9HCS2 524 aa22.09■■□□□ 1.13
CDKN2A-210ENST00000530628 LRIT1Q9P2V4 623 aa22.09■■□□□ 1.13
CDKN2A-210ENST00000530628 PISDQ9UG56 409 aa22.09■■□□□ 1.13
CDKN2A-210ENST00000530628 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CDKN2A-210ENST00000530628 MYO6Q9UM54 1294 aa22.09■■□□□ 1.13
CDKN2A-210ENST00000530628 TMEM191CA6NGB0 347 aa22.08■■□□□ 1.13
CDKN2A-210ENST00000530628 B4DGG1 531 aa22.08■■□□□ 1.13
CDKN2A-210ENST00000530628 B8ZZF3 427 aa22.08■■□□□ 1.13
CDKN2A-210ENST00000530628 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CDKN2A-210ENST00000530628 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CDKN2A-210ENST00000530628 TEX33O43247 280 aa22.08■■□□□ 1.13
CDKN2A-210ENST00000530628 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CDKN2A-210ENST00000530628 AP1S1P61966 158 aa22.08■■□□□ 1.13
CDKN2A-210ENST00000530628 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
CDKN2A-210ENST00000530628 C14orf28Q4W4Y0 310 aa22.08■■□□□ 1.13
CDKN2A-210ENST00000530628 CERCAMQ5T4B2 595 aa22.08■■□□□ 1.13
CDKN2A-210ENST00000530628 PNCKQ6P2M8 343 aa22.08■■□□□ 1.13
CDKN2A-210ENST00000530628 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
CDKN2A-210ENST00000530628 SYT11Q9BT88 431 aa22.08■■□□□ 1.13
CDKN2A-210ENST00000530628 WDR26Q9H7D7 661 aa22.08■■□□□ 1.13
CDKN2A-210ENST00000530628 SEPT3Q9UH03 358 aa22.08■■□□□ 1.13
CDKN2A-210ENST00000530628 LOXL2Q9Y4K0 774 aa22.08■■□□□ 1.13
CDKN2A-210ENST00000530628 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 NOBOXO60393 691 aa22.07■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 GM2AP17900 193 aa22.07■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 MIPP30301 263 aa22.07■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 HCAR3P49019 387 aa22.07■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 LBRQ14739 615 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 NCAPHQ15003 741 aa22.07■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 LZTR1Q8N653 840 aa22.07■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 NPWQ8N729 165 aa22.07■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 TMEM159Q96B96 161 aa22.07■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 PSKH2Q96QS6 385 aa22.07■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 LGR4Q9BXB1 951 aa22.07■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 HSD3B7Q9H2F3 369 aa22.07■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 ACSL6Q9UKU0 697 aa22.07■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 RNF215Q9Y6U7 377 aa22.07■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 PRSS38A1L453 326 aa22.06■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 NVLO15381 856 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 SLC10A7Q0GE19 358 aa22.06■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 ZNF235Q14590 738 aa22.06■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 TMCO4Q5TGY1 634 aa22.06■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa22.06■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 SPRED1Q7Z699 444 aa22.06■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 CCL4L1Q8NHW4 92 aa22.06■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 KIAA1524Q8TCG1 905 aa22.06■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 FNIP1Q8TF40 1166 aa22.06■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 ZNF599Q96NL3 588 aa22.06■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 ZWILCHQ9H900 591 aa22.06■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 KCTD5Q9NXV2 234 aa22.06■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 SEPT10Q9P0V9 454 aa22.06■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 B4GALT6Q9UBX8 382 aa22.06■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 CFAP46Q8IYW2 2715 aa22.06■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 ZNF462Q96JM2 2506 aa22.06■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 A0A1W2PQ67 120 aa22.05■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 LRRC53A6NM62 1247 aa22.05■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 AGRPO00253 132 aa22.05■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 EFSO43281 561 aa22.05■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 FTLP02792 175 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 LIPCP11150 499 aa22.05■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 ATP1A3P13637 1013 aa22.05■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 NFKBIAP25963 317 aa22.05■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 TGIF1Q15583 401 aa22.05■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 ASIC2Q16515 512 aa22.05■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 USP53Q70EK8 1073 aa22.05■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 SFTPA2Q8IWL1 248 aa22.05■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 AOPEPQ8N6M6 819 aa22.05■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 NUS1Q96E22 293 aa22.05■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 COQ10AQ96MF6 247 aa22.05■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 NSMCE3Q96MG7 304 aa22.05■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 CMKLR1Q99788 373 aa22.05■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 HAUS4Q9H6D7 363 aa22.05■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 GZMAP12544 262 aa22.04■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 ITIH1P19827 911 aa22.04■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 DPYSQ14117 519 aa22.04■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 DENND2CQ68D51 928 aa22.04■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 TP53INP2Q8IXH6 220 aa22.04■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 PELI3Q8N2H9 469 aa22.04■■□□□ 1.12
CDKN2A-210ENST00000530628 BBS5Q8N3I7 341 aa22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms