RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522344.1

CPEB4-210, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene CPEB4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB4-210ENST00000522344 OASLQ15646 514 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 SLC36A4Q6YBV0 504 aa4.27□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF329Q86UD4 541 aa4.27□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 SFR1Q86XK3 245 aa4.27□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 RFLNBQ8N5W9 214 aa4.27□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 ZBTB2Q8N680 514 aa4.27□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF441Q8N8Z8 693 aa4.27□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 BEST2Q8NFU1 509 aa4.27□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 CD101Q93033 1021 aa4.27□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 PSMD1Q99460 953 aa4.27□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 FUZQ9BT04 418 aa4.27□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 LRRC4Q9HBW1 653 aa4.27□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 GPR108Q9NPR9 543 aa4.27□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF224Q9NZL3 707 aa4.27□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa4.26□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 A0A087WYN8 130 aa4.26□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 IFNL4K9M1U5 179 aa4.26□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 NCAM2O15394 837 aa4.26□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 LINC01565O15544 149 aa4.26□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 KRT36O76013 467 aa4.26□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 TFP02787 698 aa4.26□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 CYC1P08574 325 aa4.26□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 LINC00271P0C7V0 271 aa4.26□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 SRCP12931 536 aa4.26□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 AMD1P17707 334 aa4.26□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 GNAQP50148 359 aa4.26□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 SORDQ00796 357 aa4.26□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 ECT2LQ008S8 904 aa4.26□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 CTF1Q16619 201 aa4.26□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa4.26□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 SLC45A4Q5BKX6 768 aa4.26□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 SGO1Q5FBB7 561 aa4.26□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 FAM69AQ5T7M9 428 aa4.26□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 NAA35Q5VZE5 725 aa4.26□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 ANKRD54Q6NXT1 300 aa4.26□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 KRBA2Q6ZNG9 492 aa4.26□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 TUBA1AQ71U36 451 aa4.26□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 NAGSQ8N159 534 aa4.26□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 MAB21L3Q8N8X9 362 aa4.26□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 SORCS1Q8WY21 1168 aa4.26□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 KLHL29Q96CT2 875 aa4.26□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 TMEM19Q96HH6 336 aa4.26□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 NODALQ96S42 347 aa4.26□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 TUBA1CQ9BQE3 449 aa4.26□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 HAUS8Q9BT25 410 aa4.26□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 NDST4Q9H3R1 872 aa4.26□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 C17orf75Q9HAS0 396 aa4.26□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 A4GNTQ9UNA3 340 aa4.26□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 PSAT1Q9Y617 370 aa4.26□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 STON1Q9Y6Q2 735 aa4.26□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 TMEM202A6NGA9 273 aa4.25□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 MID1O15344 667 aa4.25□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 IGLV2-11P01706 119 aa4.25□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 XBP1P17861 261 aa4.25□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 DGKAP23743 735 aa4.25□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 SHMT1P34896 483 aa4.25□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 VAMP2P63027 116 aa4.25□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 ZBTB17Q13105 803 aa4.25□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 C2orf68Q2NKX9 166 aa4.25□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa4.25□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 TXNDC8Q6A555 127 aa4.25□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 C9orf139Q6ZV77 190 aa4.25□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 MTSS1LQ765P7 747 aa4.25□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 TAOK1Q7L7X3 1001 aa4.25□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 HUS1BQ8NHY5 278 aa4.25□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 MORC4Q8TE76 937 aa4.25□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 FIG4Q92562 907 aa4.25□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 HTRA1Q92743 480 aa4.25□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 RNF125Q96EQ8 232 aa4.25□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 H2AFJQ9BTM1 129 aa4.25□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 EVA1AQ9H8M9 152 aa4.25□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa4.25□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 SAGE1Q9NXZ1 904 aa4.25□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 BICRAQ9NZM4 1560 aa4.25□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 MDFICQ9P1T7 246 aa4.25□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 TINAGQ9UJW2 476 aa4.25□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 SEC14L5O43304 696 aa4.24□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 XPNPEP2O43895 674 aa4.24□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 LMX1BO60663 402 aa4.24□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 RFPL2O75678 378 aa4.24□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 KCNA5P22460 613 aa4.24□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 MT3P25713 68 aa4.24□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 DDIT3P35638 169 aa4.24□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF132P52740 706 aa4.24□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 BRWD1-AS2P59051 145 aa4.24□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 NEXNQ0ZGT2 675 aa4.24□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 LCE1EQ5T753 118 aa4.24□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms