RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RHOT2Q8IXI1 618 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PLA2G15Q8NCC3 412 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IFI44Q8TCB0 444 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MAML1Q92585 1016 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 COQ10AQ96MF6 247 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 WDR92Q96MX6 357 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HAUS2Q9NVX0 235 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RAXQ9Y2V3 346 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GPSM3Q9Y4H4 160 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AK5Q9Y6K8 562 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DGKBQ9Y6T7 804 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM208BQ5VWN6 2430 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A8MX80 341 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF487B1APH4 448 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PSMD11O00231 422 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TNFRSF10CO14798 259 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MFSD11O43934 449 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MTA2O94776 668 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PGLSO95336 258 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CPP00450 1065 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TNFP01375 233 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRT10P13645 584 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MX2P20592 715 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KDELR1P24390 212 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 VIPR1P32241 457 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MAXP61244 160 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRAF2Q12933 501 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ACOX1Q15067 660 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CDKN3Q16667 212 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARMC12Q5T9G4 340 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ALG1LQ6GMV1 187 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 VSIG1Q86XK7 387 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HID1Q8IV36 788 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NDUFAF2Q8N183 169 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RNF214Q8ND24 703 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MAPK15Q8TD08 544 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DEPDC7Q96QD5 511 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NT5MQ9NPB1 228 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KLQ9UEF7 1012 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 INTUQ9ULD6 942 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MYLKQ15746 1914 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A0A087WV48 116 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CPED1A4D0V7 1026 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FZD6O60353 706 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GJC1P36383 396 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ITKQ08881 620 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MESDQ14696 234 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TCEAL1Q15170 157 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GUSBP11Q6P575 273 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GKN2Q86XP6 184 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC35F3Q8IY50 421 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PQLC3Q8N755 202 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR56A4Q8NGH8 313 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PIH1D2Q8WWB5 315 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NAT6Q93015 286 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GRAMD1AQ96CP6 724 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RNF157Q96PX1 679 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP16.86■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SEMA3CQ99985 751 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP16.86■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PADI4Q9UM07 663 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DOLKQ9UPQ8 538 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ASXL3Q9C0F0 2248 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCNB1P14635 433 aa16.85■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CNGA3Q16281 694 aa16.85■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa16.85■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LRRC38Q5VT99 294 aa16.85■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SARM1Q6SZW1 724 aa16.85■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 USP45Q70EL2 814 aa16.85■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RD3Q7Z3Z2 195 aa16.85■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 WDR48Q8TAF3 677 aa16.85■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RAPGEF5Q92565 580 aa16.85■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NUS1Q96E22 293 aa16.85■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPTLC3Q9NUV7 552 aa16.85■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LHX6Q9UPM6 363 aa16.85■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RAI2Q9Y5P3 530 aa16.85■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SHROOM3Q8TF72 1996 aa16.84■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM202A6NGA9 273 aa16.84■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TCEA3O75764 348 aa16.84■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PDHA1P08559 390 aa16.84■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TGM2P21980 687 aa16.84■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LHCGRP22888 699 aa16.84■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TEAD1P28347 426 aa16.84■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC1A1P43005 524 aa16.84■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GBE1Q04446 702 aa16.84■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARHGEF7Q14155 803 aa16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms