RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511276.1

FAM53C-208, Transcript of family with sequence similarity 53 member C, human

TSL 4

Gene FAM53C, Length 571 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM53C-208	ENST00000511276	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		13.28	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	FBXO8	Q9NRD0	319 aa		13.28	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		13.28	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	RRN3	Q9NYV6	651 aa		13.28	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		13.28	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	PDP2	Q9P2J9	529 aa		13.28	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	F9	P00740	461 aa		13.27	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	ERBB2	P04626	1255 aa		13.27	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	PRF1	P14222	555 aa		13.27	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	DLST	P36957	453 aa		13.27	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	STAT1	P42224	750 aa		13.27	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	SUOX	P51687	545 aa		13.27	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC6A3	Q01959	620 aa		13.27	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	DEUP1	Q05D60	604 aa		13.27	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	UGP2	Q16851	508 aa		13.27	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		13.27	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC34A3	Q8N130	599 aa		13.27	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	NETO2	Q8NC67	525 aa		13.27	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	NT5C3B	Q969T7	300 aa		13.27	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		13.27	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	13.27	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		13.27	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	HPSE	Q9Y251	543 aa		13.27	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		13.27	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	CDC14C	A4D256	554 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	INSIG1	O15503	277 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	TMCC1	O94876	653 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	PIGN	O95427	931 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	IGSF6	O95976	241 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	CMA1	P23946	247 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	TRIM23	P36406	574 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	CETN1	Q12798	172 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	13.26	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	MAP7	Q14244	749 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	PASD1	Q8IV76	773 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	TBCB	Q99426	244 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	TSG101	Q99816	390 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	CROT	Q9UKG9	612 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	INPP4B	O15327	924 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	KATNA1	O75449	491 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	RECQL5	O94762	991 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	FUCA1	P04066	466 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	MMP12	P39900	470 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	PRCP	P42785	496 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	SYK	P43405	635 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	GPLD1	P80108	840 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	SEMA5A	Q13591	1074 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	ERAP2	Q6P179	960 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	MARVELD3	Q96A59	401 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	RNF31	Q96EP0	1072 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	C5orf34	Q96MH7	638 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	WDR26	Q9H7D7	661 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	DNAI1	Q9UI46	699 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	PDZD2	O15018	2839 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	TSPAN11	A1L157	253 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	P4HA2	O15460	535 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	TEX33	O43247	280 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	BUB1	O43683	1085 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	KDELR3	O43731	214 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	PGD	P52209	483 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	RHOA	P61586	193 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	PELI3	Q8N2H9	469 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	TTC13	Q8NBP0	860 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29

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