RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498517.5

ARHGEF3-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF3, Length 787 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-215ENST00000498517 HAO1Q9UJM8 370 aa5.66□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 FZD10Q9ULW2 581 aa5.66□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 TLR6Q9Y2C9 796 aa5.66□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 C15orf41Q9Y2V0 281 aa5.66□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 TEX264Q9Y6I9 313 aa5.66□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 MYO16Q9Y6X6 1858 aa5.66□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 GREB1Q4ZG55 1949 aa5.66□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 PATJQ8NI35 1801 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 TTC28Q96AY4 2481 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 WASH4PA8MWX3 477 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 KCNU1A8MYU2 1149 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 GOLGA8RI6L899 631 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 RFXAPO00287 272 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 COPEO14579 308 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 KLF11O14901 512 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 CREB3O43889 395 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 DNAJC6O75061 913 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 RFPL2O75678 378 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 KRT38O76015 456 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 HAUS5O94927 633 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 TGDSO95455 350 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 TBX18O95935 607 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 CKMP06732 381 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 DHRS4L1P0CG22 281 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 NEFHP12036 1026 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 PFKLP17858 780 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 TPSB2P20231 275 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 MAPK1P28482 360 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 RBL1P28749 1068 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 PTPN4P29074 926 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 L1CAMP32004 1257 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCNFP41002 786 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 SERPINB9P50453 376 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 TUBP50607 506 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 ARFIP2P53365 341 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 CDK16Q00536 496 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 TPSAB1Q15661 275 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 LRIT3Q3SXY7 679 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 ACCSLQ4AC99 568 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 ATAT1Q5SQI0 421 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 TRNP1Q6NT89 227 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 MSANTD2Q6P1R3 559 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF449Q6P9G9 518 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 KLHDC10Q6PID8 442 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 TAC4Q86UU9 113 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 LONP2Q86WA8 852 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 IGDCC3Q8IVU1 814 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 PQLC3Q8N755 202 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 PLD5Q8N7P1 536 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 PPM1NQ8N819 430 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 MAB21L3Q8N8X9 362 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 MCUQ8NE86 351 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 RFWD2Q8NHY2 731 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 NSMCE1Q8WV22 266 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 NTAN1Q96AB6 310 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 TTC17Q96AE7 1141 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 MTBPQ96DY7 904 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 SERAC1Q96JX3 654 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 BTN2A3PQ96KV6 586 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 C1orf74Q96LT6 269 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 ANKRD27Q96NW4 1050 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 MIPEPQ99797 713 aa5.65□□□□□ -1.5
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ARHGEF3-215ENST00000498517 SMOC2Q9H3U7 446 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 CXorf56Q9H5V9 222 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCSER2Q9H7U1 834 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 SFXN1Q9H9B4 322 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 USP29Q9HBJ7 922 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 PIGVQ9NUD9 493 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 MKS1Q9NXB0 559 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC17A7Q9P2U7 560 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF180Q9UJW8 692 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF510Q9Y2H8 683 aa5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa5.65□□□□□ -1.5
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