RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 ADRB2P07550 413 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 RRM1P23921 792 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 SLC15A1P46059 708 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 MFAP4P55083 255 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 MTX1Q13505 466 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 C10orf25Q5T742 122 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 QSOX2Q6ZRP7 698 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 SEPT14Q6ZU15 432 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 SLC35F3Q8IY50 421 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 PIGOQ8TEQ8 1089 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 OR2A14Q96R47 310 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 CYSLTR2Q9NS75 346 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 PCDHA12Q9UN75 941 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1W2PPC1 479 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM202A6NGA9 273 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 CTDSP2O14595 271 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP7.87□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 ENTPD3O75355 529 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 CSPG5O95196 566 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 GPTP24298 496 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 NRIP1P48552 1158 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 RASSF2P50749 326 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 RRP1P56182 461 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 ST3GAL1Q11201 340 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 NEDD9Q14511 834 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 PARM1Q6UWI2 310 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 ADGRA1Q86SQ6 560 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 ELMOD3Q96FG2 381 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 PLK3Q9H4B4 646 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 COG5Q9UP83 839 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 A8MV72 311 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 ADAM10O14672 748 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 GPC4O75487 556 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 JRKO75564 520 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 KELP23276 732 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 PMS2P54278 862 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 DUSP6Q16828 381 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC96Q2M329 555 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 GARNL3Q5VVW2 1013 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 PMS2CLQ68D20 193 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 HAPLN4Q86UW8 402 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC13Q8IYE1 715 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 COQ8BQ96D53 544 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 SORCS2Q96PQ0 1159 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 SETD4Q9NVD3 440 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 TPPPO94811 219 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 CELA2AP08217 269 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 PON1P27169 355 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 RAD23BP54727 409 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 BMP2KLQ5H9B9 411 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 SCML4Q8N228 414 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 TMTC2Q8N394 836 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC191Q8NCU4 936 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 AGBL3Q8NEM8 1001 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 ENGASEQ8NFI3 743 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 SLC22A18Q96BI1 424 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 ZG16BQ96DA0 208 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 MSTO1Q9BUK6 570 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 LOC100509620A0A075B734 347 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 HIST1H2ABP04908 130 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 SELLP14151 372 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 DDX5P17844 614 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 HIST1H2ADP20671 130 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 PRCPP42785 496 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 HSD17B4P51659 736 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 CLCN3P51790 818 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 PCLAFQ15004 111 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 RASA2Q15283 850 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM266Q2M3C6 531 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 MANEAQ5SRI9 462 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
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