RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 ATF6P18850 670 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 TIE1P35590 1138 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 POLD2P49005 469 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 EOGTQ5NDL2 527 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 Q6ZVU0 165 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 DET1Q7L5Y6 550 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 FEM1AQ9BSK4 669 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF576Q9H609 170 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 ARL15Q9NXU5 204 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 CLCA2Q9UQC9 943 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 KATNA1O75449 491 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 ABLIM3O94929 683 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 PRAMEF1O95521 474 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 FAM107AO95990 144 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 ANXA5P08758 320 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 GRIA4P48058 902 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 RPL26P61254 145 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 LRRC32Q14392 662 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 DHCR24Q15392 516 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 FAM9CQ8IZT9 166 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 NAT8LQ8N9F0 302 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 SLC44A1Q8WWI5 657 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 SPACA7Q96KW9 195 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 NDNQ99608 321 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 P2RY13Q9BPV8 354 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 RXFP1Q9HBX9 757 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 ELOVL2Q9NXB9 296 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 A0A0D9SEW6 157 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 ANGPT2O15123 496 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 INPP4BO15327 924 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 CDK14O94921 469 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 KRT6AP02538 564 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 KRT6BP04259 564 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 PKMP14618 531 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 KRT6CP48668 564 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 NEK3P51956 506 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 CCNG1P51959 295 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 NAA20P61599 178 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 PRKAA1Q13131 559 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 SEL1L3Q68CR1 1132 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 SZRD1Q7Z422 152 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 OSCP1Q8WVF1 389 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 CDH19Q9H159 772 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 ADAM7Q9H2U9 754 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 ELOVL6Q9H5J4 265 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 NOD2Q9HC29 1040 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 H3BNC9 293 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM63AO94886 807 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 EPOP01588 193 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 VIPR2P41587 438 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 SLC7A9P82251 487 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 RUNX3Q13761 415 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 ARSIQ5FYB1 569 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 MPP5Q8N3R9 675 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 TUBGCP3Q96CW5 907 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 SIPA1Q96FS4 1042 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 PSKH2Q96QS6 385 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 GPSM3Q9Y4H4 160 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 MYH15Q9Y2K3 1946 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 HOXA9P31269 272 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 RAP1GDS1P52306 607 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 LMAN2Q12907 356 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 ZBTB17Q13105 803 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 SLC1A5Q15758 541 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 HDDC3Q8N4P3 179 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 TSTD1Q8NFU3 115 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 OR56A4Q8NGH8 313 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 SDCCAG3Q96C92 435 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 MYOCQ99972 504 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 RTP3Q9BQQ7 232 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 SLC35G4P0C7Q5 338 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 BGNP21810 368 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 CHRNA4P43681 627 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 MAPK9P45984 424 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 SEC24CP53992 1094 aa8.28□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms