RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 FAM46DQ8NEK8 389 aa20.22■□□□□ 0.83
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ACTB-212ENST00000484841 ASCL3Q9NQ33 180 aa20.22■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 RP1P56715 2156 aa20.22■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 NBEAQ8NFP9 2946 aa20.22■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 ASXL3Q9C0F0 2248 aa20.22■□□□□ 0.83
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ACTB-212ENST00000484841 GOLGA6BA6NDN3 693 aa20.21■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 TNFRSF10CO14798 259 aa20.21■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 SOCS5O75159 536 aa20.21■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 TNFSF15O95150 251 aa20.21■□□□□ 0.83
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ACTB-212ENST00000484841 GOLGA6DP0CG33 693 aa20.21■□□□□ 0.83
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ACTB-212ENST00000484841 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa20.21■□□□□ 0.83
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ACTB-212ENST00000484841 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 TMEM202A6NGA9 273 aa20.2■□□□□ 0.82
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ACTB-212ENST00000484841 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
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ACTB-212ENST00000484841 B4DGG1 531 aa20.19■□□□□ 0.82
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ACTB-212ENST00000484841 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
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ACTB-212ENST00000484841 MAXP61244 160 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 ZBED6P86452 979 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 RHDQ02161 417 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 USP45Q70EL2 814 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 RAB11FIP2Q7L804 512 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 LRRC49Q8IUZ0 686 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 CCNJLQ8IV13 435 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 NIPA2Q8N8Q9 360 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 MGME1Q9BQP7 344 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 TMEM168Q9H0V1 697 aa20.18■□□□□ 0.82
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