RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FZD8Q9H461 694 aa16.63■□□□□ 0.25
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EFCAB14O75071 495 aa16.63■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SIN3BO75182 1162 aa16.63■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SOX6P35712 828 aa16.63■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DENND6AQ8IWF6 608 aa16.63■□□□□ 0.25
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TSPAN14Q8NG11 270 aa16.63■□□□□ 0.25
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PPM1MQ96MI6 270 aa16.62■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TSSK3Q96PN8 268 aa16.62■□□□□ 0.25
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DHRS12A0PJE2 317 aa16.62■□□□□ 0.25
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NMBRP28336 390 aa16.62■□□□□ 0.25
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NRP2O60462 931 aa16.62■□□□□ 0.25
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa16.62■□□□□ 0.25
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FOLH1Q04609 750 aa16.61■□□□□ 0.25
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IL1BP01584 269 aa16.61■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MTX3Q5HYI7 312 aa16.61■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CHADLQ6NUI6 762 aa16.61■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RHBGQ9H310 441 aa16.61■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C5orf60A6NFR6 353 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 XYLBO75191 536 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IPO13O94829 963 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ACADMP11310 421 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SYPL2Q5VXT5 272 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CASP12Q6UXS9 341 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PQLC1Q8N2U9 271 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF781Q8N8C0 355 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM156AQ8NDB6 213 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RDH11Q8TC12 318 aa16.6■□□□□ 0.25
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