RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 CHKBQ9Y259 395 aa20.87■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 EFR3BQ9Y2G0 817 aa20.87■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 SPEGQ15772 3267 aa20.86■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 TOR1BO14657 336 aa20.86■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 MTSS1O43312 755 aa20.86■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 PCCBP05166 539 aa20.86■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 MMP2P08253 660 aa20.86■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 ALPIP09923 528 aa20.86■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 CCDC175P0C221 793 aa20.86■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 YPEL5P62699 121 aa20.86■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 CCZ1BP86790 482 aa20.86■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 BNIP3Q12983 259 aa20.86■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 ARHGEF7Q14155 803 aa20.86■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 PTK2BQ14289 1009 aa20.86■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 FZD2Q14332 565 aa20.86■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP20.86■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 CDC6Q99741 560 aa20.86■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 HERPUD2Q9BSE4 406 aa20.86■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 DNAJC28Q9NX36 388 aa20.86■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 PPIL1Q9Y3C6 166 aa20.86■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 A0A0J9YYE9 177 aa20.85■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 TRBC1P01850 177 aa20.85■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 PYGMP11217 842 aa20.85■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 LHCGRP22888 699 aa20.85■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 PTPN3P26045 913 aa20.85■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 SKOR1P84550 965 aa20.85■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 NOMO1Q15155 1222 aa20.85■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 TEX44Q53QW1 395 aa20.85■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 TPRG1LQ5T0D9 272 aa20.85■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 FAM182AQ5T1J6 154 aa20.85■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 DENND2CQ68D51 928 aa20.85■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 LPCAT1Q8NF37 534 aa20.85■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP20.85■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 HACD1B0YJ81 288 aa20.84■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 H3BM21 787 aa20.84■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 PSMD11O00231 422 aa20.84■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 TJP3O95049 919 aa20.84■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 PTMAP06454 111 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 GM2AP17900 193 aa20.84■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 RPL26P61254 145 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 MTM1Q13496 603 aa20.84■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 ZNF542PQ5EBM4 170 aa20.84■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 AADACL2Q6P093 401 aa20.84■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 MACC1Q6ZN28 852 aa20.84■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 GLRX5Q86SX6 157 aa20.84■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 TSPAN33Q86UF1 283 aa20.84■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 NUS1Q96E22 293 aa20.84■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 SLC25A51Q9H1U9 297 aa20.84■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 FTSJ1Q9UET6 329 aa20.84■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 DNPEPQ9ULA0 475 aa20.84■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 SCN8AQ9UQD0 1980 aa20.84■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 CAPN8A6NHC0 703 aa20.83■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 GOLGA8CPA6NN73 597 aa20.83■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 NME1P15531 152 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 HNF1BP35680 557 aa20.83■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP20.83■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 XRCC4Q13426 336 aa20.83■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 INPP5AQ14642 412 aa20.83■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 PTPRRQ15256 657 aa20.83■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa20.83■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 EID2Q8N6I1 236 aa20.83■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 ACTL9Q8TC94 416 aa20.83■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 HTR3CQ8WXA8 447 aa20.83■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 TEKT5Q96M29 485 aa20.83■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 COQ10AQ96MF6 247 aa20.83■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 GLOD4Q9HC38 313 aa20.83■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 KCTD5Q9NXV2 234 aa20.83■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
NELFE-208ENST00000481121 H7C0C1 242 aa20.83■□□□□ 0.92
NELFE-208ENST00000481121 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.92
NELFE-208ENST00000481121 PIAS2O75928 621 aa20.83■□□□□ 0.92
NELFE-208ENST00000481121 PRLP01236 227 aa20.83■□□□□ 0.92
NELFE-208ENST00000481121 CSF2P04141 144 aa20.83■□□□□ 0.92
NELFE-208ENST00000481121 DGKAP23743 735 aa20.83■□□□□ 0.92
NELFE-208ENST00000481121 ATP5OP48047 213 aa20.83■□□□□ 0.92
NELFE-208ENST00000481121 WASHC5Q12768 1159 aa20.83■□□□□ 0.92
NELFE-208ENST00000481121 LRRC66Q68CR7 880 aa20.83■□□□□ 0.92
NELFE-208ENST00000481121 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.92
NELFE-208ENST00000481121 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa20.83■□□□□ 0.92
NELFE-208ENST00000481121 PLA2G15Q8NCC3 412 aa20.83■□□□□ 0.92
NELFE-208ENST00000481121 DTD2Q96FN9 168 aa20.83■□□□□ 0.92
NELFE-208ENST00000481121 HES6Q96HZ4 224 aa20.83■□□□□ 0.92
NELFE-208ENST00000481121 SMIM14Q96QK8 99 aa20.83■□□□□ 0.92
NELFE-208ENST00000481121 VAT1Q99536 393 aa20.83■□□□□ 0.92
NELFE-208ENST00000481121 FERMT1Q9BQL6 677 aa20.83■□□□□ 0.92
NELFE-208ENST00000481121 ADGRE3Q9BY15 652 aa20.83■□□□□ 0.92
NELFE-208ENST00000481121 LZTFL1Q9NQ48 299 aa20.83■□□□□ 0.92
NELFE-208ENST00000481121 OR1A2Q9Y585 309 aa20.83■□□□□ 0.92
NELFE-208ENST00000481121 ZNF30P17039 623 aa20.82■□□□□ 0.92
NELFE-208ENST00000481121 HTR1BP28222 390 aa20.82■□□□□ 0.92
NELFE-208ENST00000481121 FOXC1Q12948 553 aa20.82■□□□□ 0.92
NELFE-208ENST00000481121 GALNT3Q14435 633 aa20.82■□□□□ 0.92
NELFE-208ENST00000481121 NFATC4Q14934 902 aa20.82■□□□□ 0.92
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