RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471364.1

RUBCN-208, Transcript of RUN and cysteine rich domain containing beclin 1 interacting protein, human

TSL 3

Gene RUBCN, Length 434 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RUBCN-208	ENST00000471364	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	DFFA	O00273	331 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	CDH16	O75309	829 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	DKK1	O94907	266 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	RHOQ	P17081	205 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	PRKCH	P24723	683 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	CCNC	P24863	283 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	ATP5D	P30049	168 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	GRIA1	P42261	906 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	MMP13	P45452	471 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	IRAK1	P51617	712 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	GUCY1A3	Q02108	690 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	12.81	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	FAM124A	Q86V42	546 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	NLRP14	Q86W24	1093 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	CACUL1	Q86Y37	369 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	TDRP	Q86YL5	185 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	DENND1C	Q8IV53	801 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	CPXM2	Q8N436	756 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	FBF1	Q8TES7	1133 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	DDI1	Q8WTU0	396 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	VAT1	Q99536	393 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	SELENOS	Q9BQE4	189 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	DRGX	A6NNA5	263 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	TNFSF14	O43557	240 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	MLN	P12872	115 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	GRK6	P43250	576 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	CDK16	Q00536	496 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	PPARD	Q03181	441 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	CYP4F3	Q08477	520 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	TMED2	Q15363	201 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	TEX44	Q53QW1	395 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	FBXL22	Q6P050	247 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	LRRC31	Q6UY01	552 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	MPP5	Q8N3R9	675 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	OR2T3	Q8NH03	318 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	MAML1	Q92585	1016 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	IGSF8	Q969P0	613 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	LRRC39	Q96DD0	335 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	CFAP36	Q96G28	342 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	GBA3	Q9H227	469 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	PPCS	Q9HAB8	311 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	FETUB	Q9UGM5	382 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	TBK1	Q9UHD2	729 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	PLXNA2	O75051	1894 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	TRABD2B	A6NFA1	517 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364		A6NNZ2	444 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	SPAG6	O75602	509 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	CNTN5	O94779	1100 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	CP	P00450	1065 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	JCHAIN	P01591	159 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	GSTA2	P09210	222 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	CREB1	P16220	341 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	NFKB1	P19838	968 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	TACR2	P21452	398 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RUBCN-208	ENST00000471364	GRIA4	P48058	902 aa		12.79	□□□□□ -0.36

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