RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458294.5

PBRM1-218, Transcript of polybromo 1, humanhuman

TSL 3

Gene PBRM1, Length 476 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1-218ENST00000458294 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa26.46■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 DPPA4Q7L190 304 aa26.46■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 SLITRK4Q8IW52 837 aa26.46■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 PAF1Q8N7H5 531 aa26.46■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 WDR26Q9H7D7 661 aa26.46■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 AP4E1Q9UPM8 1137 aa26.46■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa26.45■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 CD82P27701 267 aa26.45■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 KIAA1524Q8TCG1 905 aa26.45■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 B3GNT4Q9C0J1 378 aa26.45■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 SP110Q9HB58 689 aa26.45■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 CYP4F12Q9HCS2 524 aa26.45■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 CHMP5Q9NZZ3 219 aa26.45■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa26.45■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 A0A1W2PQC6 194 aa26.44■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 GM2AP17900 193 aa26.44■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 ETV5P41161 510 aa26.44■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 OGDHQ02218 1023 aa26.44■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 PNCKQ6P2M8 343 aa26.44■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 SFTPA2Q8IWL1 248 aa26.44■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 MCOLN2Q8IZK6 566 aa26.44■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa26.44■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 EXTL1Q92935 676 aa26.44■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa26.44■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 BSNQ9UPA5 3926 aa26.44■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 PRSS38A1L453 326 aa26.43■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 SFTPCP11686 197 aa26.43■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 COPB1P53618 953 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 MAPK10P53779 464 aa26.43■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 B4GALNT1Q00973 533 aa26.43■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 MAP9Q49MG5 647 aa26.43■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 PHF19Q5T6S3 580 aa26.43■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 ACAD10Q6JQN1 1059 aa26.43■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa26.43■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 DTX1Q86Y01 620 aa26.43■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 CCL4L1Q8NHW4 92 aa26.43■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 USP7Q93009 1102 aa26.43■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 LGR4Q9BXB1 951 aa26.43■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 STARD5Q9NSY2 213 aa26.43■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 FANCLQ9NW38 375 aa26.43■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 FOXJ2Q9P0K8 574 aa26.43■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 MOSPD1Q9UJG1 213 aa26.43■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa26.43■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa26.42■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 C9orf172C9J069 976 aa26.42■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 CPNE6O95741 557 aa26.42■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 CSRP3P50461 194 aa26.42■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 AP1S1P61966 158 aa26.42■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 IL10RBQ08334 325 aa26.42■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 TMEM164Q5U3C3 297 aa26.42■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 PIM3Q86V86 326 aa26.42■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 ZFAND4Q86XD8 727 aa26.42■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa26.42■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa26.42■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 SEMA6CQ9H3T2 930 aa26.42■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 LGALS16A8MUM7 142 aa26.41■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 ZW10O43264 779 aa26.41■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 DAPK3O43293 454 aa26.41■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 CCDC172P0C7W6 258 aa26.41■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 CCNB1P14635 433 aa26.41■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 ERCC2P18074 760 aa26.41■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 RENBPP51606 427 aa26.41■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 ACOX1Q15067 660 aa26.41■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 CA9Q16790 459 aa26.41■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 ERMARDQ5T6L9 678 aa26.41■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa26.41■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 RFX8Q6ZV50 586 aa26.41■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF438Q7Z4V0 828 aa26.41■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 GPBAR1Q8TDU6 330 aa26.41■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 SPOCK2Q92563 424 aa26.41■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 PSKH2Q96QS6 385 aa26.41■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 SEMA3CQ99985 751 aa26.41■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 GSDMCQ9BYG8 508 aa26.41■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 KCTD5Q9NXV2 234 aa26.41■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 A0A1W2PQ67 120 aa26.4■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 AGRPO00253 132 aa26.4■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 DFFAO00273 331 aa26.4■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 TEX33O43247 280 aa26.4■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 ITGB6P18564 788 aa26.4■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 PSMA2P25787 234 aa26.4■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 SCNN1BP51168 640 aa26.4■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 C16orf72Q14CZ0 275 aa26.4■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 VASH2Q86V25 355 aa26.4■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 PELI3Q8N2H9 469 aa26.4■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 NUS1Q96E22 293 aa26.4■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 COQ10AQ96MF6 247 aa26.4■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 ERGIC2Q96RQ1 377 aa26.4■■□□□ 1.82
PBRM1-218ENST00000458294 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.1 ms