RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446404.1

AP000402.1-201, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AP000402.1, Length 540 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP000402.1-201ENST00000446404 PIP5K1AQ99755 562 aa6.66□□□□□ -1.34
AP000402.1-201ENST00000446404 TMEM79Q9BSE2 394 aa6.66□□□□□ -1.34
AP000402.1-201ENST00000446404 MVB12BQ9H7P6 319 aa6.66□□□□□ -1.34
AP000402.1-201ENST00000446404 A4GNTQ9UNA3 340 aa6.66□□□□□ -1.34
AP000402.1-201ENST00000446404 CGNL1Q0VF96 1302 aa6.66□□□□□ -1.34
AP000402.1-201ENST00000446404 NSD2O96028 1365 aa6.66□□□□□ -1.34
AP000402.1-201ENST00000446404 BCL9LQ86UU0 1499 aa6.66□□□□□ -1.34
AP000402.1-201ENST00000446404 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
AP000402.1-201ENST00000446404 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa6.65□□□□□ -1.34
AP000402.1-201ENST00000446404 WDR91A4D1P6 747 aa6.65□□□□□ -1.34
AP000402.1-201ENST00000446404 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
AP000402.1-201ENST00000446404 IRF1P10914 325 aa6.65□□□□□ -1.34
AP000402.1-201ENST00000446404 EDN2P20800 178 aa6.65□□□□□ -1.34
AP000402.1-201ENST00000446404 ICAM3P32942 547 aa6.65□□□□□ -1.34
AP000402.1-201ENST00000446404 BSGP35613 385 aa6.65□□□□□ -1.34
AP000402.1-201ENST00000446404 AVPR1AP37288 418 aa6.65□□□□□ -1.34
AP000402.1-201ENST00000446404 ME1P48163 572 aa6.65□□□□□ -1.34
AP000402.1-201ENST00000446404 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
AP000402.1-201ENST00000446404 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
AP000402.1-201ENST00000446404 GSTA3Q16772 222 aa6.65□□□□□ -1.34
AP000402.1-201ENST00000446404 CCDC142Q17RM4 750 aa6.65□□□□□ -1.34
AP000402.1-201ENST00000446404 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
AP000402.1-201ENST00000446404 Q5PR19 223 aa6.65□□□□□ -1.34
AP000402.1-201ENST00000446404 NUGGCQ68CJ6 796 aa6.65□□□□□ -1.34
AP000402.1-201ENST00000446404 CDC73Q6P1J9 531 aa6.65□□□□□ -1.34
AP000402.1-201ENST00000446404 NEK10Q6ZWH5 1172 aa6.65□□□□□ -1.34
AP000402.1-201ENST00000446404 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa6.65□□□□□ -1.34
AP000402.1-201ENST00000446404 KIAA2013Q8IYS2 634 aa6.65□□□□□ -1.34
AP000402.1-201ENST00000446404 MMP21Q8N119 569 aa6.65□□□□□ -1.34
AP000402.1-201ENST00000446404 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa6.65□□□□□ -1.34
AP000402.1-201ENST00000446404 H2AFJQ9BTM1 129 aa6.65□□□□□ -1.34
AP000402.1-201ENST00000446404 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
AP000402.1-201ENST00000446404 LHPPQ9H008 270 aa6.65□□□□□ -1.34
AP000402.1-201ENST00000446404 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
AP000402.1-201ENST00000446404 KRT84Q9NSB2 600 aa6.65□□□□□ -1.34
AP000402.1-201ENST00000446404 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
AP000402.1-201ENST00000446404 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa6.65□□□□□ -1.34
AP000402.1-201ENST00000446404 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa6.65□□□□□ -1.34
AP000402.1-201ENST00000446404 CARD8Q9Y2G2 431 aa6.65□□□□□ -1.34
AP000402.1-201ENST00000446404 PIAS3Q9Y6X2 628 aa6.65□□□□□ -1.34
AP000402.1-201ENST00000446404 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa6.65□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 RGPD1P0DJD0 1748 aa6.64□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 KAT6BQ8WYB5 2073 aa6.64□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 PI4KAP2A4QPH2 592 aa6.64□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 SCGB1D1O95968 90 aa6.64□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 FGF2P09038 288 aa6.64□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 PCNAP12004 261 aa6.64□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 CHRNB2P17787 502 aa6.64□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 GABRB2P47870 512 aa6.64□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 PPP3CCP48454 512 aa6.64□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 CLDN2P57739 230 aa6.64□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 RUNX2Q13950 521 aa6.64□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 RABEP1Q15276 862 aa6.64□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 ETFDHQ16134 617 aa6.64□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 EPHA10Q5JZY3 1008 aa6.64□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 MANEAQ5SRI9 462 aa6.64□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 SNX30Q5VWJ9 437 aa6.64□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 MZT2BQ6NZ67 158 aa6.64□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 PARM1Q6UWI2 310 aa6.64□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa6.64□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 PXKQ7Z7A4 578 aa6.64□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 PCGF5Q86SE9 256 aa6.64□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 LURAP1LQ8IV03 231 aa6.64□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 DENND6AQ8IWF6 608 aa6.64□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 ADSSL1Q8N142 457 aa6.64□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 NGEFQ8N5V2 710 aa6.64□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 ENGASEQ8NFI3 743 aa6.64□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 COG3Q96JB2 828 aa6.64□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 YME1L1Q96TA2 773 aa6.64□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 NUF2Q9BZD4 464 aa6.64□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 TBC1D22BQ9NU19 505 aa6.64□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 KNSTRNQ9Y448 316 aa6.64□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 PSAT1Q9Y617 370 aa6.64□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 SCINQ9Y6U3 715 aa6.64□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 GLI3P10071 1580 aa6.64□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 SHANK3Q9BYB0 1731 aa6.64□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa6.63□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa6.63□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 TTC36A6NLP5 189 aa6.63□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 CCNDBP1O95273 360 aa6.63□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 SPARCP09486 303 aa6.63□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 SRD5A1P18405 259 aa6.63□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 DCTDP32321 178 aa6.63□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 RASSF2P50749 326 aa6.63□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 AFF2P51816 1311 aa6.63□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 CDH12P55289 794 aa6.63□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 SETQ01105 290 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 DUSP6Q16828 381 aa6.63□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 MAP3K19Q56UN5 1328 aa6.63□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 WDR78Q5VTH9 848 aa6.63□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 RBFAQ8N0V3 343 aa6.63□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 KCNH5Q8NCM2 988 aa6.63□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 TMEM18Q96B42 140 aa6.63□□□□□ -1.35
AP000402.1-201ENST00000446404 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms