RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439986.8

CCBE1-202, Transcript of collagen and calcium binding EGF domains 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCBE1, Length 6,227 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1-202ENST00000439986 WARSP23381 471 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CCBE1-202ENST00000439986 ARHGAP8P85298 464 aa11.63□□□□□ -0.55
CCBE1-202ENST00000439986 TAF13Q15543 124 aa11.63□□□□□ -0.55
CCBE1-202ENST00000439986 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CCBE1-202ENST00000439986 VSTM1Q6UX27 236 aa11.63□□□□□ -0.55
CCBE1-202ENST00000439986 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa11.63□□□□□ -0.55
CCBE1-202ENST00000439986 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CCBE1-202ENST00000439986 ADGRE3Q9BY15 652 aa11.63□□□□□ -0.55
CCBE1-202ENST00000439986 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa11.63□□□□□ -0.55
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CCBE1-202ENST00000439986 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa11.62□□□□□ -0.55
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CCBE1-202ENST00000439986 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
CCBE1-202ENST00000439986 HGH1Q9BTY7 390 aa11.62□□□□□ -0.55
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CCBE1-202ENST00000439986 CYP4X1Q8N118 509 aa11.62□□□□□ -0.55
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CCBE1-202ENST00000439986 SCUBE3Q8IX30 993 aa11.62□□□□□ -0.55
CCBE1-202ENST00000439986 C12orf56Q8IXR9 622 aa11.62□□□□□ -0.55
CCBE1-202ENST00000439986 SLC43A3Q8NBI5 491 aa11.62□□□□□ -0.55
CCBE1-202ENST00000439986 LRRN4Q8WUT4 740 aa11.62□□□□□ -0.55
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CCBE1-202ENST00000439986 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
CCBE1-202ENST00000439986 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP11.62□□□□□ -0.55
CCBE1-202ENST00000439986 NFAT5O94916 1531 aa11.61□□□□□ -0.55
CCBE1-202ENST00000439986 E5RJQ4 531 aa11.61□□□□□ -0.55
CCBE1-202ENST00000439986 HNF1AP20823 631 aa11.61□□□□□ -0.55
CCBE1-202ENST00000439986 FOXN2P32314 431 aa11.61□□□□□ -0.55
CCBE1-202ENST00000439986 ABCG1P45844 678 aa11.61□□□□□ -0.55
CCBE1-202ENST00000439986 CRADDP78560 199 aa11.61□□□□□ -0.55
CCBE1-202ENST00000439986 PDZK1Q5T2W1 519 aa11.61□□□□□ -0.55
CCBE1-202ENST00000439986 DCAF12L1Q5VU92 463 aa11.61□□□□□ -0.55
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