RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 SLC14A2Q15849 920 aa23.26■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 SPDYAQ5MJ70 313 aa23.26■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 LIPMQ5VYY2 423 aa23.26■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 TTC8Q8TAM2 541 aa23.26■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 RDH11Q8TC12 318 aa23.26■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 ANKRD49Q8WVL7 239 aa23.26■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 TCEAL4Q96EI5 215 aa23.26■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa23.26■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 MID2Q9UJV3 735 aa23.26■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 MYOFQ9NZM1 2061 aa23.25■■□□□ 1.31
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FAAP20-209ENST00000428120 CDC25CP30307 473 aa23.25■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 PPM1LQ5SGD2 360 aa23.25■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 MRNIPQ6NTE8 343 aa23.25■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 HTR3DQ70Z44 454 aa23.25■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 LCA5Q86VQ0 697 aa23.25■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 PARP9Q8IXQ6 854 aa23.25■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 RAD9AQ99638 391 aa23.25■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa23.25■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 NEMP2A6NFY4 417 aa23.25■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 ANKRD66B4E2M5 251 aa23.25■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF549Q6P9A3 640 aa23.25■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 NCEH1Q6PIU2 408 aa23.25■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM207Q6UWW9 146 aa23.25■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 PEX13Q92968 403 aa23.25■■□□□ 1.31
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FAAP20-209ENST00000428120 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa23.25■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 PMLP29590 882 aa23.24■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa23.24■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 TREML1Q86YW5 311 aa23.24■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 DCAF4L2Q8NA75 395 aa23.24■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa23.24■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 POF1BQ8WVV4 589 aa23.24■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 BPIFA1Q9NP55 256 aa23.24■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 C5orf42Q9H799 3197 aa23.24■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM114B3SHH9 223 aa23.24■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 MGRN1O60291 552 aa23.24■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 SYN1P17600 705 aa23.24■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 CES1P23141 567 aa23.24■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 MPSTP25325 297 aa23.24■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 BMPR1AP36894 532 aa23.24■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP23.24■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 FAM83EQ2M2I3 478 aa23.24■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 GALNT7Q86SF2 657 aa23.24■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 LMNTD2Q8IXW0 634 aa23.24■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 ADGRE3Q9BY15 652 aa23.24■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 C2orf81A6NN90 581 aa23.23■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF195O14628 629 aa23.23■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 DIAPH2O60879 1101 aa23.23■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 CD70P32970 193 aa23.23■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 IDH3AP50213 366 aa23.23■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 LMAN2Q12907 356 aa23.23■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 TUBB3Q13509 450 aa23.23■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 GPR158Q5T848 1215 aa23.23■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 TSPAN17Q96FV3 270 aa23.23■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 NSL1Q96IY1 281 aa23.23■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 C17orf80Q9BSJ5 609 aa23.23■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa23.23■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa23.23■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 GKP32189 559 aa23.22■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 CPA2P48052 419 aa23.22■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 STC1P52823 247 aa23.22■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 RCN2Q14257 317 aa23.22■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 CMTM8Q8IZV2 173 aa23.22■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 CCNYL1Q8N7R7 359 aa23.22■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa23.22■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP23.22■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 GPR150Q8NGU9 434 aa23.22■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 RIN3Q8TB24 985 aa23.22■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 INPP5DQ92835 1189 aa23.22■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 SIKE1Q9BRV8 207 aa23.22■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 TLE6Q9H808 572 aa23.22■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 ENO1P06733 434 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 RASSF2P50749 326 aa23.22■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 CLCN4P51793 760 aa23.22■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 CAMK1DQ8IU85 385 aa23.22■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 SHKBP1Q8TBC3 707 aa23.22■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 UBXN10Q96LJ8 280 aa23.22■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 CDH19Q9H159 772 aa23.22■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 CYP4F12Q9HCS2 524 aa23.22■■□□□ 1.31
FAAP20-209ENST00000428120 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
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