RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 ROPN1LQ96C74 230 aa16.42■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 GIT1Q9Y2X7 761 aa16.42■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa16.41■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 DLDP09622 509 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 SCNN1AP37088 669 aa16.41■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM117BQ6P1L5 589 aa16.41■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 KBTBD2Q8IY47 623 aa16.41■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM159Q96B96 161 aa16.41■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 KLHL5Q96PQ7 755 aa16.41■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa16.41■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 SNX6Q9UNH7 406 aa16.41■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 ITM2AO43736 263 aa16.41■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 JAK1P23458 1154 aa16.41■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 GRIA1P42261 906 aa16.41■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 PWP1Q13610 501 aa16.41■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 HERC3Q15034 1050 aa16.41■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 C9orf131Q5VYM1 1079 aa16.41■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 MON1AQ86VX9 555 aa16.41■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 C12orf42Q96LP6 360 aa16.41■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 DPEP3Q9H4B8 488 aa16.41■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 RERGLQ9H628 205 aa16.41■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 ZFP14Q9HCL3 533 aa16.41■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa16.41■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 CNTNAP1P78357 1384 aa16.41■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC28A1O00337 649 aa16.41■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 SEC24AO95486 1093 aa16.41■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 IGSF6O95976 241 aa16.41■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 TUFMP49411 452 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa16.41■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 KRT73Q86Y46 540 aa16.41■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 TWIST2Q8WVJ9 160 aa16.41■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 SKA1Q96BD8 255 aa16.41■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 SMPD4Q9NXE4 827 aa16.41■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 STYXL1Q9Y6J8 313 aa16.41■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 C5P01031 1676 aa16.41■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 ZBTB14O43829 449 aa16.41■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 TAS2R39P59534 338 aa16.41■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 DUSP28Q4G0W2 176 aa16.41■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 GPR158Q5T848 1215 aa16.41■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 UNC5BQ8IZJ1 945 aa16.41■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 SPATA22Q8NHS9 363 aa16.41■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa16.41■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 LRTOMTQ8WZ04 291 aa16.41■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 IRGQQ8WZA9 623 aa16.41■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 TWNKQ96RR1 684 aa16.41■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 FIZ1Q96SL8 496 aa16.41■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 ASB8Q9H765 288 aa16.41■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 GNPTGQ9UJJ9 305 aa16.41■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF536O15090 1300 aa16.4■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 FFAR3O14843 346 aa16.4■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 GPR42O15529 346 aa16.4■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 COX7A2P14406 83 aa16.4■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 ITGAXP20702 1163 aa16.4■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 GPR15P49685 360 aa16.4■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF554Q86TJ5 538 aa16.4■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM110Q86TL2 294 aa16.4■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 HEATR4Q86WZ0 1026 aa16.4■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 OR2T12Q8NG77 320 aa16.4■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM105AQ9NUU6 356 aa16.4■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF358Q9NW07 568 aa16.4■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 STMN3Q9NZ72 180 aa16.4■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 SELENONQ9NZV5 590 aa16.4■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 PADI4Q9UM07 663 aa16.4■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 SOWAHBA6NEL2 793 aa16.4■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 UMPSP11172 480 aa16.4■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 EPHB3P54753 998 aa16.4■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 INAQ16352 499 aa16.4■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 VPS26BQ4G0F5 336 aa16.4■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 TTC30BQ8N4P2 665 aa16.4■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 LINGO1Q96FE5 620 aa16.4■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 SNX27Q96L92 541 aa16.4■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 ADAM7Q9H2U9 754 aa16.4■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 RPL26P61254 145 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 JAG1P78504 1218 aa16.4■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 PERM1Q5SV97 790 aa16.4■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM156AQ8NDB6 213 aa16.4■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 OXSMQ9NWU1 459 aa16.4■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 CHRNGP07510 517 aa16.39■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 ABL2P42684 1182 aa16.39■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 IRF8Q02556 426 aa16.39■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 SREBF2Q12772 1141 aa16.39■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF846Q147U1 533 aa16.39■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM63BQ5T3F8 832 aa16.39■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 GLYATQ6IB77 296 aa16.39■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 CASP12Q6UXS9 341 aa16.39■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms