RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 CCDC96Q2M329 555 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-202ENST00000367364 SLC35G1Q2M3R5 365 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-202ENST00000367364 TEX35Q5T0J7 233 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-202ENST00000367364 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM268Q5VZI3 342 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-202ENST00000367364 NCAPH2Q6IBW4 605 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-202ENST00000367364 CASC1Q6TDU7 716 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-202ENST00000367364 C10orf67Q8IYJ2 551 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-202ENST00000367364 NEK11Q8NG66 645 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-202ENST00000367364 PPM1EQ8WY54 764 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-202ENST00000367364 TANKQ92844 425 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-202ENST00000367364 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-202ENST00000367364 C17orf77Q96MU5 243 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-202ENST00000367364 LRFN5Q96NI6 719 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-202ENST00000367364 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-202ENST00000367364 TRIM31Q9BZY9 425 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-202ENST00000367364 NOX4Q9NPH5 578 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-202ENST00000367364 ABCF3Q9NUQ8 709 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-202ENST00000367364 FNIP2Q9P278 1114 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-202ENST00000367364 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-202ENST00000367364 KCNS2Q9ULS6 477 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-202ENST00000367364 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-202ENST00000367364 CCDC171Q6TFL3 1326 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-202ENST00000367364 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-202ENST00000367364 PIK3R4Q99570 1358 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-202ENST00000367364 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-202ENST00000367364 PDS5BQ9NTI5 1447 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-202ENST00000367364 FANCAO15360 1455 aa3.84□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa3.84□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 MYO3AQ8NEV4 1616 aa3.84□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 MAP2K7O14733 419 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 PRSS1P07477 247 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 TNNT1P13805 278 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 CD151P48509 253 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 KRTAP10-1P60331 282 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 PDIA5Q14554 519 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 MVPQ14764 893 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 GXYLT1Q4G148 440 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 KRBA2Q6ZNG9 492 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 PLA2G4DQ86XP0 818 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 SCN4BQ8IWT1 228 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 EFCAB13Q8IY85 973 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 CCDC191Q8NCU4 936 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 CCDC112Q8NEF3 446 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 PDE11AQ9HCR9 933 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 UPB1Q9UBR1 384 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 SLC9A2Q9UBY0 812 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 KCNK7Q9Y2U2 307 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 C9orf84Q5VXU9 1444 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 FANCD2Q9BXW9 1451 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 NEURL4Q96JN8 1562 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 MADDQ8WXG6 1647 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 UNC13BO14795 1591 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 ABCC3O15438 1527 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 SSH2Q76I76 1423 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 ERBINQ96RT1 1412 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 DISP3Q9P2K9 1392 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 TMCO5BA8MYB1 307 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 MID1O15344 667 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 NEMFO60524 1076 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 SLU7O95391 586 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 TUBBP07437 444 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 WEE2P0C1S8 567 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 PATE4P0C8F1 98 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 LYL1P12980 280 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 RXRAP19793 462 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 MX1P20591 662 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 PPP2R1AP30153 589 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 MAGEA8P43361 318 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 PRIM2P49643 509 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 ANAPC15P60006 121 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 TUBB4BP68371 445 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 OASLQ15646 514 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 CCDC183Q5T5S1 534 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 WLSQ5T9L3 541 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 SARM1Q6SZW1 724 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 TADA2BQ86TJ2 420 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 GPATCH11Q8N954 259 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 PJA1Q8NG27 643 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-202ENST00000367364 CCDC26Q8TAB7 109 aa3.82□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms