RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa7.7□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa7.7□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa7.7□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 CFAP46Q8IYW2 2715 aa7.7□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 SCN8AQ9UQD0 1980 aa7.7□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 RP1P56715 2156 aa7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 ASXL3Q9C0F0 2248 aa7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1W2PQ67 120 aa7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 LRRD1A4D1F6 860 aa7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 CFAP69A5D8W1 941 aa7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 BTNL10A8MVZ5 291 aa7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 A8MX80 341 aa7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 K7ESM1 405 aa7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 MAP3K6O95382 1288 aa7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 CAPNS1P04632 268 aa7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 CKMT1AP12532 417 aa7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 NFKBIAP25963 317 aa7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 HTR1BP28222 390 aa7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 GARSP41250 739 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 PEX5P50542 639 aa7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 HADHBP55084 474 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 KIF5AQ12840 1032 aa7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 TRAF2Q12933 501 aa7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 MTM1Q13496 603 aa7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 INPP5AQ14642 412 aa7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 MESDQ14696 234 aa7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 NFATC4Q14934 902 aa7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 ACOX1Q15067 660 aa7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 DEFB133Q30KQ1 61 aa7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 PRRT3Q5FWE3 981 aa7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 RALGPS1Q5JS13 557 aa7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 LIPIQ6XZB0 460 aa7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 KIAA1328Q86T90 577 aa7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 FAM181AQ8N9Y4 354 aa7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 PLA2G15Q8NCC3 412 aa7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 SLC35G2Q8TBE7 412 aa7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 NXPE2Q96DL1 559 aa7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 TBATAQ96M53 351 aa7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 IL12RB2Q99665 862 aa7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 LRRC61Q9BV99 259 aa7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 SLC13A1Q9BZW2 595 aa7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 USP29Q9HBJ7 922 aa7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 EVA1BQ9NVM1 165 aa7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 SPASTQ9UBP0 616 aa7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 B4GALT6Q9UBX8 382 aa7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 TTLL3Q9Y4R7 772 aa7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 OR1A2Q9Y585 309 aa7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 U3KQA8 63 aa7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 ADAMTS20P59510 1910 aa7.69□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 TRABD2BA6NFA1 517 aa7.68□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 LMO7DNF2Z398 122 aa7.68□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 MATN3O15232 486 aa7.68□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 GCATO75600 419 aa7.68□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 PGLSO95336 258 aa7.68□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 GP1BAP07359 652 aa7.68□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 MYF5P13349 255 aa7.68□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 JUPP14923 745 aa7.68□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 TSHRP16473 764 aa7.68□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 GM2AP17900 193 aa7.68□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 KDELR1P24390 212 aa7.68□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 VIPR1P32241 457 aa7.68□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 NOP2P46087 812 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 BLKP51451 505 aa7.68□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 VAV2P52735 878 aa7.68□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 HK3P52790 923 aa7.68□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 KIAA1024LP59773 190 aa7.68□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 E2F1Q01094 437 aa7.68□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 PPARDQ03181 441 aa7.68□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 GBE1Q04446 702 aa7.68□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 ITKQ08881 620 aa7.68□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP7.68□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 ELOCQ15369 112 aa7.68□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 TCEA2Q15560 299 aa7.68□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 CNGA3Q16281 694 aa7.68□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 ALG11Q2TAA5 492 aa7.68□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 ARMC12Q5T9G4 340 aa7.68□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 FAXCQ5TGI0 409 aa7.68□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 LRRC38Q5VT99 294 aa7.68□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 ALG1LQ6GMV1 187 aa7.68□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 USP45Q70EL2 814 aa7.68□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 VSIG1Q86XK7 387 aa7.68□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 HID1Q8IV36 788 aa7.68□□□□□ -1.18
SGMS1-201ENST00000361543 SYCE1Q8N0S2 351 aa7.68□□□□□ -1.18
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