RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358543.8

ALKAL1-201, Transcript of ALK and LTK ligand 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ALKAL1, Length 1,217 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKAL1-201ENST00000358543 FSD1LQ9BXM9 530 aa24.36■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 MAGEE1Q9HCI5 957 aa24.36■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 PI4KAP42356 2102 aa24.35■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 SLC31A1O15431 190 aa24.35■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 ELFN1P0C7U0 828 aa24.35■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 ETS1P14921 441 aa24.35■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 LHCGRP22888 699 aa24.35■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 AKT2P31751 481 aa24.35■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 ARHGEF7Q14155 803 aa24.35■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 SLC1A5Q15758 541 aa24.35■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 CNGA3Q16281 694 aa24.35■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 SLC23A3Q6PIS1 610 aa24.35■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 CRTC1Q6UUV9 634 aa24.35■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 GLIS1Q8NBF1 620 aa24.35■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 TMEM145Q8NBT3 493 aa24.35■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 DENND6BQ8NEG7 585 aa24.35■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 KLK6Q92876 244 aa24.35■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa24.35■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 TM9SF3Q9HD45 589 aa24.35■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 KCTD5Q9NXV2 234 aa24.35■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa24.35■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 A8MX80 341 aa24.34■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 ZNF806P0C7X5 589 aa24.34■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 RPL22P35268 128 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 CDKN3Q16667 212 aa24.34■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 SIRPB2Q5JXA9 342 aa24.34■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 FAM174AQ8TBP5 190 aa24.34■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 GRK7Q8WTQ7 553 aa24.34■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 CENPTQ96BT3 561 aa24.34■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 SMIM14Q96QK8 99 aa24.34■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 ETNK1Q9HBU6 452 aa24.34■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa24.34■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 AP2A1O95782 977 aa24.33■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 AGTP01019 485 aa24.33■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 FGF1P05230 155 aa24.33■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa24.33■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 PTSQ03393 145 aa24.33■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 SEMA5AQ13591 1074 aa24.33■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 STAT4Q14765 748 aa24.33■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 PTPRRQ15256 657 aa24.33■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 CSRP2Q16527 193 aa24.33■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 LRRC66Q68CR7 880 aa24.33■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 PRUNE1Q86TP1 453 aa24.33■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 TSPAN33Q86UF1 283 aa24.33■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 IQCHQ86VS3 1027 aa24.33■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 COQ10AQ96MF6 247 aa24.33■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 SLC6A18Q96N87 628 aa24.33■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 FICDQ9BVA6 458 aa24.33■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 LRRC40Q9H9A6 602 aa24.33■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 ARNT2Q9HBZ2 717 aa24.33■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 PCYOX1Q9UHG3 505 aa24.33■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 SLC6A14Q9UN76 642 aa24.33■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa24.33■■□□□ 1.49
ALKAL1-201ENST00000358543 CACNA1EQ15878 2313 aa24.33■■□□□ 1.48
ALKAL1-201ENST00000358543 LRRK1Q38SD2 2015 aa24.32■■□□□ 1.48
ALKAL1-201ENST00000358543 CCDC188H7C350 402 aa24.32■■□□□ 1.48
ALKAL1-201ENST00000358543 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
ALKAL1-201ENST00000358543 GFRA3O60609 400 aa24.32■■□□□ 1.48
ALKAL1-201ENST00000358543 GM2AP17900 193 aa24.32■■□□□ 1.48
ALKAL1-201ENST00000358543 TGM1P22735 817 aa24.32■■□□□ 1.48
ALKAL1-201ENST00000358543 CD38P28907 300 aa24.32■■□□□ 1.48
ALKAL1-201ENST00000358543 SPEM2Q0P670 501 aa24.32■■□□□ 1.48
ALKAL1-201ENST00000358543 OVGP1Q12889 678 aa24.32■■□□□ 1.48
ALKAL1-201ENST00000358543 FAXCQ5TGI0 409 aa24.32■■□□□ 1.48
ALKAL1-201ENST00000358543 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
ALKAL1-201ENST00000358543 MFSD2AQ8NA29 543 aa24.32■■□□□ 1.48
ALKAL1-201ENST00000358543 SLCO2A1Q92959 643 aa24.32■■□□□ 1.48
ALKAL1-201ENST00000358543 FAM122AQ96E09 287 aa24.32■■□□□ 1.48
ALKAL1-201ENST00000358543 RUNDC3BQ96NL0 473 aa24.32■■□□□ 1.48
ALKAL1-201ENST00000358543 TRABDQ9H4I3 376 aa24.32■■□□□ 1.48
ALKAL1-201ENST00000358543 CAPN10Q9HC96 672 aa24.32■■□□□ 1.48
ALKAL1-201ENST00000358543 RAB6BQ9NRW1 208 aa24.32■■□□□ 1.48
ALKAL1-201ENST00000358543 SEMA4GQ9NTN9 838 aa24.32■■□□□ 1.48
ALKAL1-201ENST00000358543 COQ6Q9Y2Z9 468 aa24.32■■□□□ 1.48
ALKAL1-201ENST00000358543 NEU2Q9Y3R4 380 aa24.32■■□□□ 1.48
ALKAL1-201ENST00000358543 FAM186AA6NE01 2351 aa24.32■■□□□ 1.48
ALKAL1-201ENST00000358543 A0A1W2PR77 199 aa24.31■■□□□ 1.48
ALKAL1-201ENST00000358543 WNT9AO14904 365 aa24.31■■□□□ 1.48
ALKAL1-201ENST00000358543 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
ALKAL1-201ENST00000358543 RAD51BO15315 384 aa24.31■■□□□ 1.48
ALKAL1-201ENST00000358543 PLXNA2O75051 1894 aa24.31■■□□□ 1.48
ALKAL1-201ENST00000358543 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
ALKAL1-201ENST00000358543 PLA2G5P39877 138 aa24.31■■□□□ 1.48
ALKAL1-201ENST00000358543 CHRNA4P43681 627 aa24.31■■□□□ 1.48
ALKAL1-201ENST00000358543 LRRC14Q15048 493 aa24.31■■□□□ 1.48
ALKAL1-201ENST00000358543 ACOX1Q15067 660 aa24.31■■□□□ 1.48
ALKAL1-201ENST00000358543 TEAD4Q15561 434 aa24.31■■□□□ 1.48
ALKAL1-201ENST00000358543 TRIM61Q5EBN2 209 aa24.31■■□□□ 1.48
ALKAL1-201ENST00000358543 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa24.31■■□□□ 1.48
ALKAL1-201ENST00000358543 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa24.31■■□□□ 1.48
ALKAL1-201ENST00000358543 DCLK2Q8N568 766 aa24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms