RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 FAM86C1Q9NVL1 165 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 LTBP3Q9NS15 1303 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 TRIM49BA6NDI0 452 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 SLC16A4O15374 487 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 GMFGO60234 142 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 ULK1O75385 1050 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 HLA-DRAP01903 254 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 CBSLP0DN79 551 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 RAG1P15918 1043 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 KLRC1P26715 233 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 CBSP35520 551 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 IRF5Q13568 498 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 SEC23BQ15437 767 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 ATF7IP2Q5U623 682 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 ANKRD22Q5VYY1 191 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 KCNMB4Q86W47 210 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 CLYBLQ8N0X4 340 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 FBXO39Q8N4B4 442 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 SPOCK2Q92563 424 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 SMARCD1Q96GM5 515 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 CHP1Q99653 195 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 TM9SF2Q99805 663 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 DPY30Q9C005 99 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 RHOJQ9H4E5 214 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 SLA2Q9H6Q3 261 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 JMJD4Q9H9V9 463 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 INTS13Q9NVM9 706 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 PACSIN3Q9UKS6 424 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 CLIC2O15247 247 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 PDPK1O15530 556 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 TEX33O43247 280 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 LATO43561 262 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 XYLBO75191 536 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 FAM228BP0C875 321 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 OAFQ86UD1 273 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 PLEKHO2Q8TD55 490 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 KCTD13Q8WZ19 329 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 NDNQ99608 321 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 TLR10Q9BXR5 811 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 ELOVL6Q9H5J4 265 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 FKBPLQ9UIM3 349 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 MAFFQ9ULX9 164 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 NWD2Q9ULI1 1742 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 FAM86C2PA6NEL3 165 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 MYMKA6NI61 221 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 GRAP2O75791 330 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 IMPDH1P20839 514 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 FSTL1Q12841 308 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 TRIM32Q13049 653 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 ADGRD1Q6QNK2 874 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 QSOX2Q6ZRP7 698 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 TXNRD3Q86VQ6 643 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 RNF135Q8IUD6 432 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 PARP8Q8N3A8 854 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 SLC5A5Q92911 643 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 MLXIPLQ9NP71 852 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 MYNNQ9NPC7 610 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 KLQ9UEF7 1012 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 ITGB4P16144 1822 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 PRORSD1PA6NEY8 169 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 PGRMC2O15173 223 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 PTTG1O95997 202 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 COX4I1P13073 169 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 SLC6A4P31645 630 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 UQCRC1P31930 480 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 CCR1P32246 355 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 FLT3P36888 993 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 NRIP1P48552 1158 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 PTPN5P54829 565 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 PSPHP78330 225 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 GRIK3Q13003 919 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF280DQ6N043 979 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC149Q6ZUS6 474 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 RIOX2Q8IUF8 465 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 SLAIN1Q8ND83 568 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 SLC22A17Q8WUG5 538 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 HTR3CQ8WXA8 447 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 AKT1S1Q96B36 256 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 ASB9Q96DX5 294 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms