RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348333.7

TNFRSF25-201, Transcript of TNF receptor superfamily member 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFRSF25, Length 1,119 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25-201ENST00000348333 SPTLC3Q9NUV7 552 aa22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 SIRPGQ9P1W8 387 aa22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 KLQ9UEF7 1012 aa22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 A0A087WV48 116 aa22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 RASGRP1O95267 797 aa22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 ITPKBP27987 946 aa22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 GARSP41250 739 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 TSPAN33Q86UF1 283 aa22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 VSTM4Q8IW00 320 aa22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 SFTPA2Q8IWL1 248 aa22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 TEX26Q8N6G2 289 aa22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 PQLC3Q8N755 202 aa22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 OR8K1Q8NGG5 319 aa22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 SPOCK2Q92563 424 aa22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 ABCG4Q9H172 646 aa22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 TSPY26PQ9H489 355 aa22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 UVRAGQ9P2Y5 699 aa22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 MPOP05164 745 aa22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 TPM3P06753 285 aa22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 PDHA1P08559 390 aa22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 ALPIP09923 528 aa22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 H2AFZP0C0S5 128 aa22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 CTPS1P17812 591 aa22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 HTR1BP28222 390 aa22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 VIPR1P32241 457 aa22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 KIAA1024LP59773 190 aa22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 GBE1Q04446 702 aa22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 RFLNAQ6ZTI6 216 aa22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 H2AFVQ71UI9 128 aa22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 PDZD3Q86UT5 571 aa22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 KCTD6Q8NC69 237 aa22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 DEPDC7Q96QD5 511 aa22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 SEMA3CQ99985 751 aa22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 ABHD10Q9NUJ1 306 aa22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 GULP1Q9UBP9 304 aa22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 RABGEF1Q9UJ41 708 aa22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 CACNA1GO43497 2377 aa22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 PMS2P1A4D2B8 440 aa22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 CBFA2T2O43439 604 aa22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 MFAP3LO75121 409 aa22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 PGLSO95336 258 aa22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 CTSEP14091 401 aa22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 DSC2Q02487 901 aa22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 MESDQ14696 234 aa22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 PNCKQ6P2M8 343 aa22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 BBS5Q8N3I7 341 aa22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 NSMCE1Q8WV22 266 aa22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 RAPGEF5Q92565 580 aa22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 MAML1Q92585 1016 aa22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 FAF2Q96CS3 445 aa22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 NUS1Q96E22 293 aa22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF670Q9BS34 389 aa22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 DEF6Q9H4E7 631 aa22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 EVA1BQ9NVM1 165 aa22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 PADI4Q9UM07 663 aa22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 DOLKQ9UPQ8 538 aa22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF25-201ENST00000348333 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF25-201ENST00000348333 USP12O75317 370 aa22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF25-201ENST00000348333 TMEM253P0C7T8 217 aa22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF25-201ENST00000348333 TRIM23P36406 574 aa22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF25-201ENST00000348333 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF25-201ENST00000348333 ETV3P41162 512 aa22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF25-201ENST00000348333 BLKP51451 505 aa22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF25-201ENST00000348333 TRIM14Q14142 442 aa22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF25-201ENST00000348333 ELOCQ15369 112 aa22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF25-201ENST00000348333 ISXQ2M1V0 245 aa22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF25-201ENST00000348333 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF25-201ENST00000348333 OR56A4Q8NGH8 313 aa22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF25-201ENST00000348333 CCL4L1Q8NHW4 92 aa22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF25-201ENST00000348333 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF25-201ENST00000348333 PIH1D2Q8WWB5 315 aa22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF25-201ENST00000348333 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF25-201ENST00000348333 CCDC3Q9BQI4 270 aa22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF25-201ENST00000348333 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF25-201ENST00000348333 PHTF1Q9UMS5 762 aa22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF25-201ENST00000348333 RAI2Q9Y5P3 530 aa22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF25-201ENST00000348333 LOC400499M0QZD8 3231 aa22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF25-201ENST00000348333 IGSF10Q6WRI0 2623 aa22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF25-201ENST00000348333 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF25-201ENST00000348333 AKR1B10O60218 316 aa22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF25-201ENST00000348333 FZD6O60353 706 aa22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF25-201ENST00000348333 PDX1P52945 283 aa22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF25-201ENST00000348333 GABREP78334 506 aa22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF25-201ENST00000348333 ITKQ08881 620 aa22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF25-201ENST00000348333 ARMC12Q5T9G4 340 aa22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF25-201ENST00000348333 Q6ZVL8 140 aa22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF25-201ENST00000348333 ARL10Q8N8L6 244 aa22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms