RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338045.7

LIMS1-202, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMS1, Length 1,876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-202ENST00000338045 FAM107BQ9H098 131 aa15.5■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 S1PR5Q9H228 398 aa15.5■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 LMCD1Q9NZU5 365 aa15.5■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 REV3LO60673 3130 aa15.5■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 OR51F1A6NGY5 319 aa15.5■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 WASH3PC4AMC7 463 aa15.5■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 C2P06681 752 aa15.5■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 GSTA1P08263 222 aa15.5■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 ABL2P42684 1182 aa15.5■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 SERPINB4P48594 390 aa15.5■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 EPHB1P54762 984 aa15.5■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 FCHO2Q0JRZ9 810 aa15.5■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 PDGFRLQ15198 375 aa15.5■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 ZSCAN26Q16670 478 aa15.5■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 PPM1JQ5JR12 505 aa15.5■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 TANGO2Q6ICL3 276 aa15.5■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 CPLX4Q7Z7G2 160 aa15.5■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 CLEC14AQ86T13 490 aa15.5■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 OR4L1Q8NH43 312 aa15.5■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 FRS2Q8WU20 508 aa15.5■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 E2F7Q96AV8 911 aa15.5■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 ZFYVE19Q96K21 471 aa15.5■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 PRO3102Q9H379 93 aa15.5■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 EBF3Q9H4W6 596 aa15.5■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 ZNF576Q9H609 170 aa15.5■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 CAB39LQ9H9S4 337 aa15.5■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 ZFP14Q9HCL3 533 aa15.5■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 SLC39A10Q9ULF5 831 aa15.5■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 ZNF711Q9Y462 761 aa15.5■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 DOCK8Q8NF50 2099 aa15.49■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 A0A096LPK6 155 aa15.49■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 A0A0J9YYE9 177 aa15.49■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa15.49■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 H7C0S8 307 aa15.49■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 TULP3O75386 442 aa15.49■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 POP4O95707 220 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 S1PR4O95977 384 aa15.49■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 TRBC1P01850 177 aa15.49■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 ASLP04424 464 aa15.49■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 OGNP20774 298 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 CLCN5P51795 746 aa15.49■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 TMPRSS15P98073 1019 aa15.49■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 USP10Q14694 798 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 PTPRRQ15256 657 aa15.49■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 CTC1Q2NKJ3 1217 aa15.49■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 ZNF789Q5FWF6 425 aa15.49■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 ATAT1Q5SQI0 421 aa15.49■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 CNSTQ6PJW8 725 aa15.49■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 VITQ6UXI7 678 aa15.49■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa15.49■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 ECT2Q9H8V3 914 aa15.49■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 HPS4Q9NQG7 708 aa15.49■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 EMCNQ9ULC0 261 aa15.49■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 HMGCLP35914 325 aa15.48■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 CDKN3Q16667 212 aa15.48■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 TYSND1Q2T9J0 566 aa15.48■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 ACCSLQ4AC99 568 aa15.48■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 MRNIPQ6NTE8 343 aa15.48■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 AFTPHQ6ULP2 937 aa15.48■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 Q6ZVU0 165 aa15.48■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 PIGWQ7Z7B1 504 aa15.48■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 LCA5Q86VQ0 697 aa15.48■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 ZSWIM9Q86XI8 627 aa15.48■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 ARMC2Q8NEN0 867 aa15.48■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 OR2A12Q8NGT7 310 aa15.48■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 LRRC8CQ8TDW0 803 aa15.48■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 EID2BQ96D98 161 aa15.48■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 LYSMD1Q96S90 227 aa15.48■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 MYADMQ96S97 322 aa15.48■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa15.48■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 IL17CQ9P0M4 197 aa15.48■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 PPIL1Q9Y3C6 166 aa15.48■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 PLIN3O60664 434 aa15.48■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 TBX10O75333 385 aa15.48■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 DLDP09622 509 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 BMP1P13497 986 aa15.48■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 POU4F1Q01851 419 aa15.48■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 DBN1Q16643 649 aa15.48■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 PTPRNQ16849 979 aa15.48■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 CES5AQ6NT32 575 aa15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms