RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 UNC50Q53HI1 259 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 OVOS1Q6IE37 1185 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 TEX26Q8N6G2 289 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 RSPH1Q8WYR4 309 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 ERVK-6Q9BXR3 956 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 TANC1Q9C0D5 1861 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 ARHGEF37A1IGU5 675 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF23P17027 643 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 YWHAQP27348 245 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 STX1BP61266 288 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 ACVR1Q04771 509 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 PIK3R6Q5UE93 754 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 HMBOX1Q6NT76 420 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 MSANTD2Q6P1R3 559 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 FUNDC1Q8IVP5 155 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 THEM5Q8N1Q8 247 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 SLC39A13Q96H72 371 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 ALG9Q9H6U8 611 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 ABCD2Q9UBJ2 740 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 TRPM7Q96QT4 1865 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 BPTFQ12830 3046 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 TMCC1O94876 653 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 CHRNA1P02708 482 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 FGF4P08620 206 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 BMP2P12643 396 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 RHOQP17081 205 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 FDXRP22570 491 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 CD86P42081 329 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 GPR162Q16538 588 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 NRF1Q16656 503 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 MTX3Q5HYI7 312 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 DHFR2Q86XF0 187 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 CLYBLQ8N0X4 340 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 GOLM1Q8NBJ4 401 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 OR2T34Q8NGX1 318 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 OR2T3Q8NH03 318 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 PEX13Q92968 403 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 ZUFSPQ96AP4 578 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 ANKRD60Q9BZ19 345 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 NMUR1Q9HB89 426 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 NT5MQ9NPB1 228 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 TLR6Q9Y2C9 796 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 H6PDO95479 791 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 IGHA2P01877 340 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 TYMPP19971 482 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 KCNC1P48547 511 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 SUOXP51687 545 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 SLC7A2P52569 658 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 GPR158Q5T848 1215 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 MARC1Q5VT66 337 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 CLEC6AQ6EIG7 209 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 PRMT9Q6P2P2 845 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 ISLR2Q6UXK2 745 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 OR9I1Q8NGQ6 314 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 POPDC3Q9HBV1 291 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM248Q9NWD8 314 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 GPR182O15218 404 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 SUPT7LO94864 414 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 CSPG5O95196 566 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 SLC2A3P11169 496 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 ALDH3B2P48448 385 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 ARSDP51689 593 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 MGAT3Q09327 533 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 TUSC3Q13454 348 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 IHHQ14623 411 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 PPP4R4Q6NUP7 873 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 AMIGO2Q86SJ2 522 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 PACRGLQ8N7B6 248 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 TSPAN14Q8NG11 270 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 PTERQ96BW5 349 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 HMCESQ96FZ2 354 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 SUSD3Q96L08 255 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 UROC1Q96N76 676 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 CYP2S1Q96SQ9 504 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 PNPLA3Q9NST1 481 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 SNX13Q9Y5W8 968 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 CEPT1Q9Y6K0 416 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 SQORQ9Y6N5 450 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXD1-201ENST00000331462 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa22.58■■□□□ 1.2
HOXD1-201ENST00000331462 KPNA6O60684 536 aa22.58■■□□□ 1.2
HOXD1-201ENST00000331462 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
HOXD1-201ENST00000331462 CD1DP15813 335 aa22.58■■□□□ 1.2
HOXD1-201ENST00000331462 TUBA4AP68366 448 aa22.58■■□□□ 1.2
HOXD1-201ENST00000331462 SLC10A7Q0GE19 358 aa22.58■■□□□ 1.2
HOXD1-201ENST00000331462 ERMP1Q7Z2K6 904 aa22.58■■□□□ 1.2
HOXD1-201ENST00000331462 SPNS2Q8IVW8 549 aa22.58■■□□□ 1.2
HOXD1-201ENST00000331462 GPR150Q8NGU9 434 aa22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms