RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323929.7

MRE11-201, Transcript of MRE11 homolog, double strand break repair nuclease, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene MRE11, Length 6,897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11-201ENST00000323929 LRIG2O94898 1065 aa7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 DGKGP49619 791 aa7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 ERVK-21P61565 698 aa7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 TRABD2AQ86V40 505 aa7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 GLMNQ92990 594 aa7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 PHF21AQ96BD5 680 aa7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 DNAJC28Q9NX36 388 aa7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 PSME2Q9UL46 239 aa7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 RAB23Q9ULC3 237 aa7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 YIPF1Q9Y548 306 aa7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 SERPINA6P08185 405 aa7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 TRPC1P48995 793 aa7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 GPM6BQ13491 265 aa7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 RALGPS1Q5JS13 557 aa7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 NAT16Q8N8M0 369 aa7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 PXYLP1Q8TE99 480 aa7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 FEM1CQ96JP0 617 aa7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 UNC93B1Q9H1C4 597 aa7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 LTBP4Q8N2S1 1624 aa7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 CNPP09543 421 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 IDO1P14902 403 aa7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 RUNX1T1Q06455 604 aa7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 BNIP2Q12982 314 aa7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 KIAA0408Q6ZU52 694 aa7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 TMEM110Q86TL2 294 aa7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 TDRPQ86YL5 185 aa7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 HSD3B7Q9H2F3 369 aa7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 CREBZFQ9NS37 354 aa7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 SOHLH2Q9NX45 425 aa7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 NDUFA13Q9P0J0 144 aa7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 LGALS13Q9UHV8 139 aa7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 SUFUQ9UMX1 484 aa7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 ANGPT4Q9Y264 503 aa7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 AZIN1O14977 448 aa7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 AVILO75366 819 aa7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 GSNP06396 782 aa7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 PLK1P53350 603 aa7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 INCA1Q0VD86 236 aa7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 LPIN1Q14693 890 aa7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 TSTD2Q5T7W7 516 aa7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 RFWD3Q6PCD5 774 aa7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 DLK2Q6UY11 383 aa7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 ZYG11AQ6WRX3 759 aa7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 MAGED4Q96JG8 741 aa7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 EXOC2Q96KP1 924 aa7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 RETREG1Q9H6L5 497 aa7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 NDOR1Q9UHB4 597 aa7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 INVSQ9Y283 1065 aa7.55□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 PIPSLA2A3N6 862 aa7.54□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 BUD23O43709 281 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 WDR47O94967 919 aa7.54□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 COX4I1P13073 169 aa7.54□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 PKMP14618 531 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 TLE2Q04725 743 aa7.54□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 ABRQ12979 859 aa7.54□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 TCEAL1Q15170 157 aa7.54□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 ADGRD1Q6QNK2 874 aa7.54□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 KRT73Q86Y46 540 aa7.54□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 CLYBLQ8N0X4 340 aa7.54□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 SCLYQ96I15 445 aa7.54□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 C9orf16Q9BUW7 83 aa7.54□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 SMOC2Q9H3U7 446 aa7.54□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 KRT84Q9NSB2 600 aa7.54□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 CLIC5Q9NZA1 410 aa7.54□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 XPR1Q9UBH6 696 aa7.54□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 RPS6KA6Q9UK32 745 aa7.54□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 CHKBQ9Y259 395 aa7.54□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa7.54□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 GABRDO14764 452 aa7.54□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 ULK1O75385 1050 aa7.54□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 CNMDO75829 334 aa7.54□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 APOA1P02647 267 aa7.54□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 ATP6V1C1P21283 382 aa7.54□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 LRPAP1P30533 357 aa7.54□□□□□ -1.2
MRE11-201ENST00000323929 CXCR3P49682 368 aa7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms