RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311626.8

HOXB3-201, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 2,642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-201ENST00000311626 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
HOXB3-201ENST00000311626 TRPM7Q96QT4 1865 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXB3-201ENST00000311626 IQCA1LA6NCM1 817 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXB3-201ENST00000311626 RBP1P09455 135 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXB3-201ENST00000311626 RGS2P41220 211 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXB3-201ENST00000311626 SH3BP2P78314 561 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXB3-201ENST00000311626 TRIM32Q13049 653 aa25.4■■□□□ 1.66
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HOXB3-201ENST00000311626 ACAP2Q15057 778 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXB3-201ENST00000311626 GEN1Q17RS7 908 aa25.4■■□□□ 1.66
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HOXB3-201ENST00000311626 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
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HOXB3-201ENST00000311626 OR13C4Q8NGS5 318 aa25.4■■□□□ 1.66
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HOXB3-201ENST00000311626 B3GALT6Q96L58 329 aa25.4■■□□□ 1.66
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HOXB3-201ENST00000311626 ZNF839A8K0R7 811 aa25.39■■□□□ 1.66
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HOXB3-201ENST00000311626 ARPP19P56211 112 aa25.39■■□□□ 1.66
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HOXB3-201ENST00000311626 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa25.39■■□□□ 1.66
HOXB3-201ENST00000311626 SERPINB11Q96P15 392 aa25.39■■□□□ 1.66
HOXB3-201ENST00000311626 OCEL1Q9H607 264 aa25.39■■□□□ 1.66
HOXB3-201ENST00000311626 ATP13A1Q9HD20 1204 aa25.39■■□□□ 1.66
HOXB3-201ENST00000311626 EPS15L1Q9UBC2 864 aa25.39■■□□□ 1.66
HOXB3-201ENST00000311626 A0A0U1RQF3 1178 aa25.39■■□□□ 1.65
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HOXB3-201ENST00000311626 KIF19Q2TAC6 998 aa25.39■■□□□ 1.65
HOXB3-201ENST00000311626 RETREG3Q86VR2 466 aa25.39■■□□□ 1.65
HOXB3-201ENST00000311626 HERC6Q8IVU3 1022 aa25.39■■□□□ 1.65
HOXB3-201ENST00000311626 MYO1HQ8N1T3 1032 aa25.39■■□□□ 1.65
HOXB3-201ENST00000311626 DLG3Q92796 817 aa25.39■■□□□ 1.65
HOXB3-201ENST00000311626 SUSD3Q96L08 255 aa25.39■■□□□ 1.65
HOXB3-201ENST00000311626 CIB1Q99828 191 aa25.39■■□□□ 1.65
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HOXB3-201ENST00000311626 A0A1B0GTL3 188 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXB3-201ENST00000311626 TRIM24O15164 1050 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXB3-201ENST00000311626 AP1G1O43747 822 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXB3-201ENST00000311626 ARMC3Q5W041 872 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXB3-201ENST00000311626 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
HOXB3-201ENST00000311626 ATAD1Q8NBU5 361 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXB3-201ENST00000311626 MPP4Q96JB8 637 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXB3-201ENST00000311626 SMIM14Q96QK8 99 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXB3-201ENST00000311626 TRIM62Q9BVG3 475 aa25.38■■□□□ 1.65
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HOXB3-201ENST00000311626 Q9Y3F1 56 aa25.38■■□□□ 1.65
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HOXB3-201ENST00000311626 NRP2O60462 931 aa25.38■■□□□ 1.65
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HOXB3-201ENST00000311626 GOT2P00505 430 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
HOXB3-201ENST00000311626 GRB7Q14451 532 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXB3-201ENST00000311626 PFKFB4Q16877 469 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXB3-201ENST00000311626 MYLK3Q32MK0 819 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXB3-201ENST00000311626 FBXL22Q6P050 247 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF683Q8IZ20 524 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXB3-201ENST00000311626 ARRDC2Q8TBH0 407 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXB3-201ENST00000311626 TSPAN17Q96FV3 270 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXB3-201ENST00000311626 SEMA3CQ99985 751 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXB3-201ENST00000311626 ZYG11BQ9C0D3 744 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXB3-201ENST00000311626 BTRCQ9Y297 605 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXB3-201ENST00000311626 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
HOXB3-201ENST00000311626 CKMT2P17540 419 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXB3-201ENST00000311626 CHRM3P20309 590 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXB3-201ENST00000311626 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP25.37■■□□□ 1.65
HOXB3-201ENST00000311626 OR4D1Q15615 310 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXB3-201ENST00000311626 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
HOXB3-201ENST00000311626 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP25.37■■□□□ 1.65
HOXB3-201ENST00000311626 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXB3-201ENST00000311626 VPS45Q9NRW7 570 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXB3-201ENST00000311626 CROTQ9UKG9 612 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXB3-201ENST00000311626 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
HOXB3-201ENST00000311626 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
HOXB3-201ENST00000311626 RPL10P27635 214 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
HOXB3-201ENST00000311626 RPL5P46777 297 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
HOXB3-201ENST00000311626 ECT2LQ008S8 904 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXB3-201ENST00000311626 LSAMPQ13449 338 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXB3-201ENST00000311626 C6orf10Q5SRN2 563 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXB3-201ENST00000311626 HMBOX1Q6NT76 420 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXB3-201ENST00000311626 BEND5Q7L4P6 421 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXB3-201ENST00000311626 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXB3-201ENST00000311626 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
HOXB3-201ENST00000311626 C19orf60Q96EN9 201 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXB3-201ENST00000311626 SPAG4Q9NPE6 437 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXB3-201ENST00000311626 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
HOXB3-201ENST00000311626 PTPRDP23468 1912 aa25.37■■□□□ 1.65
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