RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285681.6

USP25-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,216 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-202ENST00000285681 STK32AQ8WU08 396 aa20.29■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 ACAT2Q9BWD1 397 aa20.29■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 FZD8Q9H461 694 aa20.29■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 CLIC5Q9NZA1 410 aa20.29■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 SNX3O60493 162 aa20.28■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP20.28■□□□□ 0.849e-7■■□□□ 11.5
USP25-202ENST00000285681 CCNCP24863 283 aa20.28■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 L1CAMP32004 1257 aa20.28■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 TAPT1Q6NXT6 567 aa20.28■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 ZNF549Q6P9A3 640 aa20.28■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 CMC1Q7Z7K0 106 aa20.28■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 DSELQ8IZU8 1212 aa20.28■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 PPP1R14AQ96A00 147 aa20.28■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa20.28■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 A0A1B0GW55 424 aa20.28■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 DUX4L2P0CJ85 424 aa20.28■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 DUX4L3P0CJ86 424 aa20.28■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 DUX4L4P0CJ87 422 aa20.28■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 DUX4L5P0CJ88 424 aa20.28■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 DUX4L6P0CJ89 424 aa20.28■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 DUX4L7P0CJ90 424 aa20.28■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 HK2P52789 917 aa20.28■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 ZNF605Q86T29 641 aa20.28■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 SLC4A5Q9BY07 1137 aa20.28■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 DUX4Q9UBX2 424 aa20.28■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 RPS6KA6Q9UK32 745 aa20.28■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 CORO2BQ9UQ03 480 aa20.28■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 ANGPT4Q9Y264 503 aa20.28■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 PKMP14618 531 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 PSMD8P48556 350 aa20.28■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 CLK3P49761 638 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 GCNT7Q6ZNI0 430 aa20.28■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 BNIPLQ7Z465 357 aa20.28■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 TAC4Q86UU9 113 aa20.28■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 NELL1Q92832 810 aa20.28■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 FEM1CQ96JP0 617 aa20.28■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 CPQQ9Y646 472 aa20.28■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 LRIG2O94898 1065 aa20.27■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 NR2F1P10589 423 aa20.27■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 TSNQ15631 228 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 HGSNATQ68CP4 663 aa20.27■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 AADATQ8N5Z0 425 aa20.27■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 KLHL23Q8NBE8 558 aa20.27■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 DDHD1Q8NEL9 900 aa20.27■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 MAGEH1Q9H213 219 aa20.27■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 KCTD5Q9NXV2 234 aa20.27■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa20.27■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 NOL4O94818 638 aa20.27■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 DLGAP3O95886 979 aa20.27■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 TRIM16LQ309B1 348 aa20.27■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 LINGO4Q6UY18 593 aa20.27■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 C17orf64Q86WR6 236 aa20.27■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 DNAJB14Q8TBM8 379 aa20.27■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 TEKT5Q96M29 485 aa20.27■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 ATRNL1Q5VV63 1379 aa20.27■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 KCNU1A8MYU2 1149 aa20.27■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 COX4I1P13073 169 aa20.27■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 CCL14Q16627 93 aa20.27■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 CAB39LQ9H9S4 337 aa20.27■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa20.27■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 MAP2K7O14733 419 aa20.27■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 HIST1H2ABP04908 130 aa20.27■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 RPL17P18621 184 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 GPAT3Q53EU6 434 aa20.27■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa20.27■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 CCDC103Q8IW40 242 aa20.27■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 ING5Q8WYH8 240 aa20.27■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 HIST1H2ACQ93077 130 aa20.27■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 ATG13O75143 517 aa20.26■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 SPAM1P38567 509 aa20.26■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 MAPKAPK2P49137 400 aa20.26■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 CDC73Q6P1J9 531 aa20.26■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 PARGQ86W56 976 aa20.26■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 ABCG4Q9H172 646 aa20.26■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa20.26■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 MYL12BO14950 172 aa20.26■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 C8AP07357 584 aa20.26■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 CDH13P55290 713 aa20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms