RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256646.6

NOTCH2-201, Transcript of notch 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOTCH2, Length 11,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH2-201ENST00000256646 TUFMP49411 452 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 RAB27AP51159 221 aa9.96□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 TGFB2P61812 414 aa9.96□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 MAMLD1Q13495 774 aa9.96□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 PEX6Q13608 980 aa9.96□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 ZNF613Q6PF04 617 aa9.96□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 RASSF1Q9NS23 344 aa9.96□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 KBTBD4Q9NVX7 518 aa9.96□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 DPP7Q9UHL4 492 aa9.96□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 IKZF2Q9UKS7 526 aa9.96□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 SERPINA1P01009 418 aa9.96□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 ELNP15502 786 aa9.96□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 AKR1D1P51857 326 aa9.96□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 ZNF730Q6ZMV8 503 aa9.96□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 OTOP3Q7RTS5 596 aa9.96□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 FAIM2Q9BWQ8 316 aa9.96□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 STARD13Q9Y3M8 1113 aa9.96□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 CYP3A4P08684 503 aa9.96□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 ACAP2Q15057 778 aa9.96□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 IKBIPQ70UQ0 350 aa9.96□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 LMAN2LQ9H0V9 348 aa9.96□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 PNPOQ9NVS9 261 aa9.96□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 OR7A10O76100 309 aa9.96□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 COX4I1P13073 169 aa9.96□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 SLC6A2P23975 617 aa9.96□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 PGDP52209 483 aa9.96□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 AMZ1Q400G9 498 aa9.96□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 NOMO2Q5JPE7 1267 aa9.96□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 HTRA1Q92743 480 aa9.96□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 DHRS7Q9Y394 339 aa9.96□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 A2ML1A8K2U0 1454 aa9.96□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 ADRB2P07550 413 aa9.96□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 BMP7P18075 431 aa9.96□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 KCNK18Q7Z418 384 aa9.96□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 FIBCD1Q8N539 461 aa9.96□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 ZNF366Q8N895 744 aa9.96□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 GAL3ST3Q96A11 431 aa9.96□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa9.96□□□□□ -0.82
NOTCH2-201ENST00000256646 SLC35G4P0C7Q5 338 aa9.96□□□□□ -0.82
NOTCH2-201ENST00000256646 SKP1P63208 163 aa9.96□□□□□ -0.82
NOTCH2-201ENST00000256646 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
NOTCH2-201ENST00000256646 DNASE1L2Q92874 299 aa9.96□□□□□ -0.82
NOTCH2-201ENST00000256646 RCN3Q96D15 328 aa9.96□□□□□ -0.82
NOTCH2-201ENST00000256646 CNPPD1Q9BV87 410 aa9.96□□□□□ -0.82
NOTCH2-201ENST00000256646 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
NOTCH2-201ENST00000256646 RGS20O76081 388 aa9.96□□□□□ -0.82
NOTCH2-201ENST00000256646 PSMG1O95456 288 aa9.96□□□□□ -0.82
NOTCH2-201ENST00000256646 QPRTQ15274 297 aa9.96□□□□□ -0.82
NOTCH2-201ENST00000256646 PSMD5Q16401 504 aa9.96□□□□□ -0.82
NOTCH2-201ENST00000256646 FAM182AQ5T1J6 154 aa9.96□□□□□ -0.82
NOTCH2-201ENST00000256646 GPR158Q5T848 1215 aa9.96□□□□□ -0.82
NOTCH2-201ENST00000256646 AFTPHQ6ULP2 937 aa9.96□□□□□ -0.82
NOTCH2-201ENST00000256646 OR14C36Q8NHC7 312 aa9.96□□□□□ -0.82
NOTCH2-201ENST00000256646 SAP18O00422 153 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
NOTCH2-201ENST00000256646 AHCYL1O43865 530 aa9.96□□□□□ -0.82
NOTCH2-201ENST00000256646 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
NOTCH2-201ENST00000256646 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
NOTCH2-201ENST00000256646 GABRR2P28476 465 aa9.96□□□□□ -0.82
NOTCH2-201ENST00000256646 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
NOTCH2-201ENST00000256646 IL18Q14116 193 aa9.96□□□□□ -0.82
NOTCH2-201ENST00000256646 SQLEQ14534 574 aa9.96□□□□□ -0.82
NOTCH2-201ENST00000256646 PARP6Q2NL67 630 aa9.96□□□□□ -0.82
NOTCH2-201ENST00000256646 MINDY4Q4G0A6 757 aa9.96□□□□□ -0.82
NOTCH2-201ENST00000256646 SLC34A3Q8N130 599 aa9.96□□□□□ -0.82
NOTCH2-201ENST00000256646 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
NOTCH2-201ENST00000256646 GAL3ST4Q96RP7 486 aa9.96□□□□□ -0.82
NOTCH2-201ENST00000256646 C11orf16Q9NQ32 467 aa9.96□□□□□ -0.82
NOTCH2-201ENST00000256646 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
NOTCH2-201ENST00000256646 CCL22O00626 93 aa9.96□□□□□ -0.82
NOTCH2-201ENST00000256646 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
NOTCH2-201ENST00000256646 ARL10Q8N8L6 244 aa9.96□□□□□ -0.82
NOTCH2-201ENST00000256646 CACNG4Q9UBN1 327 aa9.96□□□□□ -0.82
NOTCH2-201ENST00000256646 G3V2T6 193 aa9.95□□□□□ -0.82
NOTCH2-201ENST00000256646 CDH13P55290 713 aa9.95□□□□□ -0.82
NOTCH2-201ENST00000256646 KCNA10Q16322 511 aa9.95□□□□□ -0.82
NOTCH2-201ENST00000256646 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
NOTCH2-201ENST00000256646 LIN54Q6MZP7 749 aa9.95□□□□□ -0.82
NOTCH2-201ENST00000256646 TMEM199Q8N511 208 aa9.95□□□□□ -0.82
NOTCH2-201ENST00000256646 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
NOTCH2-201ENST00000256646 IL22Q9GZX6 179 aa9.95□□□□□ -0.82
NOTCH2-201ENST00000256646 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
NOTCH2-201ENST00000256646 ZNF879B4DU55 563 aa9.95□□□□□ -0.82
NOTCH2-201ENST00000256646 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP9.95□□□□□ -0.82
NOTCH2-201ENST00000256646 SEMA3DO95025 777 aa9.95□□□□□ -0.82
NOTCH2-201ENST00000256646 FCER2P06734 321 aa9.95□□□□□ -0.82
NOTCH2-201ENST00000256646 SAGP10523 405 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
NOTCH2-201ENST00000256646 SPIRE1Q08AE8 756 aa9.95□□□□□ -0.82
NOTCH2-201ENST00000256646 CBX3Q13185 183 aa9.95□□□□□ -0.82
NOTCH2-201ENST00000256646 SP140Q13342 867 aa9.95□□□□□ -0.82
NOTCH2-201ENST00000256646 CERCAMQ5T4B2 595 aa9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms