RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000248121.6

SYNGR3-201, Transcript of synaptogyrin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYNGR3, Length 2,051 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3-201ENST00000248121 SPO11Q9Y5K1 396 aa23.44■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 H0YHG0 523 aa23.43■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 DNAJC6O75061 913 aa23.43■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 MT-CO1P00395 513 aa23.43■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 PDHA1P08559 390 aa23.43■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 KITP10721 976 aa23.43■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 SLC1A6P48664 564 aa23.43■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 DLG1Q12959 904 aa23.43■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 SLC12A1Q13621 1099 aa23.43■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 ITGA9Q13797 1035 aa23.43■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 FBXW10Q5XX13 1052 aa23.43■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 CRLF3Q8IUI8 442 aa23.43■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 GPATCH11Q8N954 259 aa23.43■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 OR13C4Q8NGS5 318 aa23.43■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 OR6P1Q8NGX9 317 aa23.43■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 SKA1Q96BD8 255 aa23.43■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 ELMO2Q96JJ3 720 aa23.43■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 GPR78Q96P69 363 aa23.43■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 SMIM14Q96QK8 99 aa23.43■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 NUDCD1Q96RS6 583 aa23.43■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 SORT1Q99523 831 aa23.43■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 SCUBE2Q9NQ36 999 aa23.43■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 TRIM33Q9UPN9 1127 aa23.43■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa23.42■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 K7ERQ8 282 aa23.42■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 T-ENOLP0DO92 83 aa23.42■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 RALBP11234 206 aa23.42■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 STMN1P16949 149 aa23.42■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 CTC1Q2NKJ3 1217 aa23.42■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa23.42■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 NDNQ99608 321 aa23.42■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 TK2O00142 265 aa23.42■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 UNC5CO95185 931 aa23.42■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 SERPINB3P29508 390 aa23.42■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 PRAMEP78395 509 aa23.42■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 TRIM68Q6AZZ1 485 aa23.42■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 NAPRTQ6XQN6 538 aa23.42■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 ASRGL1Q7L266 308 aa23.42■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 CLNKQ7Z7G1 428 aa23.42■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 PEX13Q92968 403 aa23.42■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 ASIC4Q96FT7 647 aa23.42■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 LMLNQ96KR4 655 aa23.42■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 OLFM1Q99784 485 aa23.42■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 SLC40A1Q9NP59 571 aa23.42■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 KCNK4Q9NYG8 393 aa23.42■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 LHX3Q9UBR4 397 aa23.42■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 ACOT9Q9Y305 439 aa23.42■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa23.42■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 TRIM24O15164 1050 aa23.41■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 S1PR4O95977 384 aa23.41■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 HLA-FP30511 346 aa23.41■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 FAM78AQ5JUQ0 283 aa23.41■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 LY6G5CQ5SRR4 150 aa23.41■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 GALNT7Q86SF2 657 aa23.41■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 FGF13Q92913 245 aa23.41■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 ZFP69BQ9UJL9 534 aa23.41■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 TARM1B6A8C7 271 aa23.4■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 RASSF9O75901 435 aa23.4■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 GOT2P00505 430 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 COL6A2P12110 1019 aa23.4■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 BMP1P13497 986 aa23.4■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 GRK2P25098 689 aa23.4■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 GLRBP48167 497 aa23.4■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 POU4F1Q01851 419 aa23.4■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 MPP7Q5T2T1 576 aa23.4■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 SPATA6LQ8N4H0 392 aa23.4■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 ABCB8Q9NUT2 735 aa23.4■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 FSHRP23945 695 aa23.4■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 TARSP26639 723 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 CRABP2P29373 138 aa23.4■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 GPR149Q86SP6 731 aa23.4■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 LCA5Q86VQ0 697 aa23.4■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 MDGA1Q8NFP4 955 aa23.4■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 FIBINQ8TAL6 211 aa23.4■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 NXNL1Q96CM4 212 aa23.4■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 BBS2Q9BXC9 721 aa23.4■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 PRO3102Q9H379 93 aa23.4■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 SPHK2Q9NRA0 654 aa23.4■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 RIMKLBQ9ULI2 386 aa23.4■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa23.4■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 RAI2Q9Y5P3 530 aa23.4■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 CCDC162PA2VCL2 907 aa23.39■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 SOBPA7XYQ1 873 aa23.39■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 PENKP01210 267 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
SYNGR3-201ENST00000248121 CES1P23141 567 aa23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms