RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216416.8

CNIH1-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH1, Length 4,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH1-201ENST00000216416 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 WASH4PA8MWX3 477 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 TBX10O75333 385 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 SUN1O94901 812 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 CHRNGP07510 517 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 PMLP29590 882 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 GP5P40197 560 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 MAPKAPK2P49137 400 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
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CNIH1-201ENST00000216416 TSTD2Q5T7W7 516 aa6.6□□□□□ -1.35
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CNIH1-201ENST00000216416 HTR3DQ70Z44 454 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 KIF2BQ8N4N8 673 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 LRRC8CQ8TDW0 803 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 PHTF1Q9UMS5 762 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 GOLGA8OA6NCC3 632 aa6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 GOLGA8NF8WBI6 632 aa6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 CYBBP04839 570 aa6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 CYP17A1P05093 508 aa6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 CR2P20023 1033 aa6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 CPA2P48052 419 aa6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 ERVK-21P61565 698 aa6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 PRSS36Q5K4E3 855 aa6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 ADIPOR2Q86V24 386 aa6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF276Q8N554 614 aa6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 FRMD1Q8N878 549 aa6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 CKAP2Q8WWK9 683 aa6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 TIFAQ96CG3 184 aa6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 NRTNQ99748 197 aa6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 MGME1Q9BQP7 344 aa6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 EBF4Q9BQW3 602 aa6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 CD93Q9NPY3 652 aa6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 VPS45Q9NRW7 570 aa6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 COL4A3Q01955 1670 aa6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 OBSL1O75147 1896 aa6.59□□□□□ -1.35
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CNIH1-201ENST00000216416 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 XYLBO75191 536 aa6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 USP1O94782 785 aa6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 FAM107AO95990 144 aa6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 CCDC166P0CW27 439 aa6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 NAGLUP54802 743 aa6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 SLC7A9P82251 487 aa6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF449Q6P9G9 518 aa6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 TXNDC11Q6PKC3 985 aa6.59□□□□□ -1.35
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CNIH1-201ENST00000216416 RBBP8Q99708 897 aa6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 GDF15Q99988 308 aa6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 KIFC1Q9BW19 673 aa6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 POMKQ9H5K3 350 aa6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 DENND4CQ5VZ89 1909 aa6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 KNTC1P50748 2209 aa6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 DMXL1Q9Y485 3027 aa6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 NEMP1O14524 444 aa6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 STX7O15400 261 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 CACNG3O60359 315 aa6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 LEFTY1O75610 366 aa6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 JUNP05412 331 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 MLNP12872 115 aa6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 LHCGRP22888 699 aa6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 MC4RP32245 332 aa6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 HNF1BP35680 557 aa6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 HADHAP40939 763 aa6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 ETV4P43268 484 aa6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 PEX6Q13608 980 aa6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF549Q6P9A3 640 aa6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF576Q9H609 170 aa6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 PNPOQ9NVS9 261 aa6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 MSRAQ9UJ68 235 aa6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 GGA2Q9UJY4 613 aa6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 PRKAB1Q9Y478 270 aa6.59□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa6.58□□□□□ -1.36
CNIH1-201ENST00000216416 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CNIH1-201ENST00000216416 NDST3O95803 873 aa6.58□□□□□ -1.36
CNIH1-201ENST00000216416 GSRP00390 522 aa6.58□□□□□ -1.36
CNIH1-201ENST00000216416 GDI1P31150 447 aa6.58□□□□□ -1.36
CNIH1-201ENST00000216416 BCL2L1Q07817 233 aa6.58□□□□□ -1.36
CNIH1-201ENST00000216416 PTPRNQ16849 979 aa6.58□□□□□ -1.36
CNIH1-201ENST00000216416 MPPE1Q53F39 396 aa6.58□□□□□ -1.36
CNIH1-201ENST00000216416 Q6ZVL8 140 aa6.58□□□□□ -1.36
CNIH1-201ENST00000216416 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CNIH1-201ENST00000216416 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CNIH1-201ENST00000216416 MARK4Q96L34 752 aa6.58□□□□□ -1.36
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