RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635970.1

CLN8-209, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

TSL 5

Gene CLN8, Length 1,958 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-209ENST00000635970 DNASE1L2Q92874 299 aa15.62■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 CLPTM1LQ96KA5 538 aa15.62■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 TBCBQ99426 244 aa15.62■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 NPY6RQ99463 290 aa15.62■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 RAB6CQ9H0N0 254 aa15.62■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 TLR6Q9Y2C9 796 aa15.62■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa15.62■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 CUL9Q8IWT3 2517 aa15.61■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 M0QYT0 321 aa15.61■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 APOL1O14791 398 aa15.61■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 PRPSAP2O60256 369 aa15.61■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 AVILO75366 819 aa15.61■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 KITP10721 976 aa15.61■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 DESP17661 470 aa15.61■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 GPD1P21695 349 aa15.61■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 PFKPQ01813 784 aa15.61■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 SIGLEC14Q08ET2 396 aa15.61■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 TUBB3Q13509 450 aa15.61■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 RUNX3Q13761 415 aa15.61■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 PDGFRLQ15198 375 aa15.61■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 UNC5AQ6ZN44 842 aa15.61■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 SIX5Q8N196 739 aa15.61■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 PLD5Q8N7P1 536 aa15.61■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa15.61■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 RXFP2Q8WXD0 754 aa15.61■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 CHFRQ96EP1 664 aa15.61■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 TMCO1Q9UM00 188 aa15.61■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 C2CD4BA6NLJ0 364 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 ATP9BO43861 1147 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 CYP17A1P05093 508 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 SERPINE1P05121 402 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 VCLP18206 1134 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 MTM1Q13496 603 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 CDO1Q16878 200 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 SLC44A4Q53GD3 710 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 SLC9A4Q6AI14 798 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 RAPH1Q70E73 1250 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 NT5C3BQ969T7 300 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 P2RY11Q96G91 374 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 SLC39A13Q96H72 371 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 NDNQ99608 321 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 EPAS1Q99814 870 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 PIGVQ9NUD9 493 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 MOCS1Q9NZB8 636 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 STAP1Q9ULZ2 295 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 PIAS3Q9Y6X2 628 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 SHISA7A6NL88 538 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 CREB3O43889 395 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 OPHN1O60890 802 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 GCATO75600 419 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 ALDH1A2O94788 518 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 APRTP07741 180 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 MLNP12872 115 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 CD72P21854 359 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 SLC1A6P48664 564 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 HARS2P49590 506 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 DEUP1Q05D60 604 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 KRT81Q14533 505 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 SLC25A52Q3SY17 297 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 CCDC14Q49A88 953 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 FSCBQ5H9T9 825 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 SH2D4BQ5SQS7 431 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 CES4AQ5XG92 561 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 MBLAC2Q68D91 279 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 TRIM67Q6ZTA4 783 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 TPRG1Q6ZUI0 275 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 CDKL2Q92772 493 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 SIGLEC10Q96LC7 697 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 Q9H521 79 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 PLAC1Q9HBJ0 212 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 TRPV5Q9NQA5 729 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 TBC1D14Q9P2M4 693 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 ATXN10Q9UBB4 475 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 WNT16Q9UBV4 365 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 SIN3BO75182 1162 aa15.59■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 NFATC1O95644 943 aa15.59■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 PDGFRAP16234 1089 aa15.59■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 CHN2P52757 468 aa15.59■□□□□ 0.09
CLN8-209ENST00000635970 PDE1BQ01064 536 aa15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.8 ms