RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617062.4

CU633904.1-201, humanhuman

TSL 5

Gene CU633904.1, Length 560 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CU633904.1-201ENST00000617062 SKILP12757 684 aa8.85□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 XPAP23025 273 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 NFKBIAP25963 317 aa8.85□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 TEAD1P28347 426 aa8.85□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 TRIM23P36406 574 aa8.85□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 RGRP47804 291 aa8.85□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 ARSEP51690 589 aa8.85□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 THOP1P52888 689 aa8.85□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 CDH6P55285 790 aa8.85□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 KIAA1024LP59773 190 aa8.85□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 DAB2P98082 770 aa8.85□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 BCL2L1Q07817 233 aa8.85□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 RALGDSQ12967 914 aa8.85□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 TRIM14Q14142 442 aa8.85□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 LBRQ14739 615 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 NFATC4Q14934 902 aa8.85□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 IRF4Q15306 451 aa8.85□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 ALG1LQ6GMV1 187 aa8.85□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 TMCO3Q6UWJ1 677 aa8.85□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 DPPA4Q7L190 304 aa8.85□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 ZSWIM9Q86XI8 627 aa8.85□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 VSIG1Q86XK7 387 aa8.85□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 CAMK1DQ8IU85 385 aa8.85□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 PHACTR4Q8IZ21 702 aa8.85□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 TEX26Q8N6G2 289 aa8.85□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 GLMNQ92990 594 aa8.85□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 NAT6Q93015 286 aa8.85□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 EXOC2Q96KP1 924 aa8.85□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 DEPDC7Q96QD5 511 aa8.85□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 NUDCD1Q96RS6 583 aa8.85□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 LRRC61Q9BV99 259 aa8.85□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 SLC13A1Q9BZW2 595 aa8.85□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 THAP2Q9H0W7 228 aa8.85□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP8.85□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 UVRAGQ9P2Y5 699 aa8.85□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 AMACRQ9UHK6 382 aa8.85□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 RAXQ9Y2V3 346 aa8.85□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 PPIL1Q9Y3C6 166 aa8.85□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP8.85□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 A0A087X0T9 212 aa8.84□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa8.84□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 ZNF487B1APH4 448 aa8.84□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa8.84□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 MYO1FO00160 1098 aa8.84□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 PSMD11O00231 422 aa8.84□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 DFFAO00273 331 aa8.84□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 MUSKO15146 869 aa8.84□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 FFAR2O15552 330 aa8.84□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 MAFKO60675 156 aa8.84□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 ALPIP09923 528 aa8.84□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 FAM228BP0C875 321 aa8.84□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 IL4RP24394 825 aa8.84□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 HTR1BP28222 390 aa8.84□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 MAN1A1P33908 653 aa8.84□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 RPIAP49247 311 aa8.84□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 LIG3P49916 1009 aa8.84□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 HK3P52790 923 aa8.84□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 PPARDQ03181 441 aa8.84□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 ELOCQ15369 112 aa8.84□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 NR0B2Q15466 257 aa8.84□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 LRRC73Q5JTD7 316 aa8.84□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 CFAP58Q5T655 872 aa8.84□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 LIPIQ6XZB0 460 aa8.84□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa8.84□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 MARCH9Q86YJ5 346 aa8.84□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 LSMEM2Q8N112 164 aa8.84□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 BBS5Q8N3I7 341 aa8.84□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 OR6C4Q8NGE1 309 aa8.84□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 IFI44Q8TCB0 444 aa8.84□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 FAF2Q96CS3 445 aa8.84□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 DNAJC7Q99615 494 aa8.84□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 IL12RB2Q99665 862 aa8.84□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 ZNF670Q9BS34 389 aa8.84□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 NUP85Q9BW27 656 aa8.84□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 PCDH18Q9HCL0 1135 aa8.84□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 ETNK2Q9NVF9 386 aa8.84□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 BAHCC1Q9P281 2608 aa8.84□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 MYO1AQ9UBC5 1043 aa8.84□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 ANAPC7Q9UJX3 599 aa8.84□□□□□ -0.99
CU633904.1-201ENST00000617062 GCATO75600 419 aa8.83□□□□□ -1
CU633904.1-201ENST00000617062 NEBLO76041 1014 aa8.83□□□□□ -1
CU633904.1-201ENST00000617062 RASGRP1O95267 797 aa8.83□□□□□ -1
CU633904.1-201ENST00000617062 ELFN1P0C7U0 828 aa8.83□□□□□ -1
CU633904.1-201ENST00000617062 TCF4P15884 667 aa8.83□□□□□ -1
CU633904.1-201ENST00000617062 TSHRP16473 764 aa8.83□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms