RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	STRADB	Q9C0K7	418 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	LRRC19	Q9H756	370 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	FZD10	Q9ULW2	581 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	RELN	P78509	3460 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	WASH4P	A8MWX3	477 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338		B4DGG1	531 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	WISP1	O95388	367 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	JMJD7	P0C870	316 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	LIPC	P11150	499 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	HTR1B	P28222	390 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	SUOX	P51687	545 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	OGDH	Q02218	1023 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	KRT31	Q15323	416 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	SGF29	Q96ES7	293 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM74	Q96NL1	305 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	MCEE	Q96PE7	176 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	VPS16	Q9H269	839 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	APPL1	Q9UKG1	709 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	C9orf172	C9J069	976 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	NVL	O15381	856 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	PRAMEF11	O60813	436 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	RECQL5	O94762	991 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM87A	P0C7U9	286 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	ITGB6	P18564	788 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	KIAA1024L	P59773	190 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	KCNC4	Q03721	635 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	12	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	ERAP2	Q6P179	960 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	USP53	Q70EK8	1073 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	LGR4	Q9BXB1	951 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	PCDHGA4	Q9Y5G9	962 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	ZFC3H1	O60293	1989 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	TNF	P01375	233 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	CALB1	P05937	261 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	GLB1	P16278	677 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	TPI1	P60174	286 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	CYP4F2	P78329	520 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	CA9	Q16790	459 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	CFAP58	Q5T655	872 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	LIPI	Q6XZB0	460 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	DTX1	Q86Y01	620 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	NPW	Q8N729	165 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	OR6C4	Q8NGE1	309 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	ATL2	Q8NHH9	583 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	PMEPA1	Q969W9	287 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	CNPY3	Q9BT09	278 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	RDH14	Q9HBH5	336 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	STARD5	Q9NSY2	213 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	DACH1	Q9UI36	760 aa		11.99	□□□□□ -0.49

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