RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 KLRB1Q12918 225 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-205ENST00000588780 TTI2Q6NXR4 508 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-205ENST00000588780 TRIM65Q6PJ69 517 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-205ENST00000588780 FOXR2Q6PJQ5 311 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-205ENST00000588780 CCL4L1Q8NHW4 92 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-205ENST00000588780 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-205ENST00000588780 MIB2Q96AX9 1013 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-205ENST00000588780 C18orf8Q96DM3 657 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-205ENST00000588780 CFAP57Q96MR6 1250 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-205ENST00000588780 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-205ENST00000588780 PCDH12Q9NPG4 1184 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-205ENST00000588780 OR12D3Q9UGF7 316 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-205ENST00000588780 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-205ENST00000588780 LRP4O75096 1905 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-205ENST00000588780 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-205ENST00000588780 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-205ENST00000588780 DUX1O43812 170 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-205ENST00000588780 PIGNO95427 931 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-205ENST00000588780 RHOQP17081 205 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-205ENST00000588780 MPSTP25325 297 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-205ENST00000588780 FLT3P36888 993 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-205ENST00000588780 ARSDP51689 593 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-205ENST00000588780 STX17P56962 302 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-205ENST00000588780 ATP11AP98196 1134 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-205ENST00000588780 APBA1Q02410 837 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-205ENST00000588780 DCAF12Q5T6F0 453 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-205ENST00000588780 PLA2G15Q8NCC3 412 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-205ENST00000588780 TMEM35BQ8NCS4 154 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-205ENST00000588780 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC45A3Q96JT2 553 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-205ENST00000588780 DDA1Q9BW61 102 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-205ENST00000588780 KCNK4Q9NYG8 393 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-205ENST00000588780 INSIG1O15503 277 aa21.89■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 KDELR3O43731 214 aa21.89■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 KRT7P08729 469 aa21.89■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC9A1P19634 815 aa21.89■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 MLLT10P55197 1068 aa21.89■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 KIAA1024LP59773 190 aa21.89■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 CDC20Q12834 499 aa21.89■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 UGP2Q16851 508 aa21.89■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 NKAIN2Q5VXU1 208 aa21.89■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 C16orf46Q6P387 395 aa21.89■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 KDELC2Q7Z4H8 507 aa21.89■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC47A2Q86VL8 602 aa21.89■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 TEX19Q8NA77 164 aa21.89■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 SHC3Q92529 594 aa21.89■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 VOPP1Q96AW1 172 aa21.89■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 EXOC2Q96KP1 924 aa21.89■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 EFHD1Q9BUP0 239 aa21.89■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 APEX2Q9UBZ4 518 aa21.89■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa21.89■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 EFCAB7A8K855 629 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 PRKCGP05129 697 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 NOP2P46087 812 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 LIMK2P53671 638 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 CDO1Q16878 200 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 ARTNQ5T4W7 220 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 UNC5BQ8IZJ1 945 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 SPATA20Q8TB22 786 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 TMEM248Q9NWD8 314 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 TNFRSF10CO14798 259 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 TEX33O43247 280 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 VPS4BO75351 444 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 CD1CP29017 333 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 C2CD6Q53TS8 623 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 FHL5Q5TD97 284 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 ANKS6Q68DC2 871 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 GBP6Q6ZN66 633 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 NLGN4XQ8N0W4 816 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 TBC1D31Q96DN5 1066 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 GSDMCQ9BYG8 508 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 SUV39H2Q9H5I1 410 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 OCIAD1Q9NX40 245 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 VPS4AQ9UN37 437 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 ECEL1O95672 775 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 SCNN1AP37088 669 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 COPB1P53618 953 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 MARSP56192 900 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 RAB15P59190 212 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 MC1RQ01726 317 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 NLRP14Q86W24 1093 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 XYLT1Q86Y38 959 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 MSANTD4Q8NCY6 345 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 OR4D9Q8NGE8 314 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 WDR26Q9H7D7 661 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 MAN1B1Q9UKM7 699 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms