RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582772.1

MSI2-216, Transcript of musashi RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene MSI2, Length 398 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSI2-216	ENST00000582772	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF174	Q15697	407 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	RAB43	Q86YS6	212 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	HID1	Q8IV36	788 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	FANCB	Q8NB91	859 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	KIFAP3	Q92845	792 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	PWWP2A	Q96N64	755 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	ASB7	Q9H672	318 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	DNM3	Q9UQ16	869 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	ATP8B3	O60423	1300 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	MYH11	P35749	1972 aa		4.96	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	DSCAM	O60469	2012 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	ESPN	B1AK53	854 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	FAM157A	C9JC47	383 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	TCF21	O43680	179 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	SLC37A4	O43826	429 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	DNAJC6	O75061	913 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	DNAJB6	O75190	326 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	LATS1	O95835	1130 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	CDC25A	P30304	524 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	CTSC	P53634	463 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	PTK2	Q05397	1052 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	NFATC2	Q13469	925 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	BECN1	Q14457	450 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	TMTC2	Q8N394	836 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	TBCK	Q8TEA7	893 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	HAS1	Q92839	578 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	CNDP1	Q96KN2	507 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	NLN	Q9BYT8	704 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	TRIM7	Q9C029	511 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	DPP3	Q9NY33	737 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	RNF6	Q9Y252	685 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772		A8MU76	341 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	MDM4	O15151	490 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	PPM1D	O15297	605 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	TIAF1	O95411	115 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	SLFN14	P0C7P3	912 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	RXRA	P19793	462 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	LMO2	P25791	158 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	DDIT3	P35638	169 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	ETV3	P41162	512 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	LIFR	P42702	1097 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	NPTX2	P47972	431 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	FASLG	P48023	281 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	NNT	Q13423	1086 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	TNK1	Q13470	666 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772		Q6ZPA2	131 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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