RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566336.5

NAE1-215, Transcript of NEDD8 activating enzyme E1 subunit 1, human

TSL 5

Gene NAE1, Length 686 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NAE1-215	ENST00000566336	PPP2CB	P62714	309 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	PPP2CA	P67775	309 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	PRR5	P85299	388 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	SPAG1	Q07617	926 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	MCL1	Q07820	350 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	FOXM1	Q08050	763 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	SEMA5A	Q13591	1074 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	MPP2	Q14168	576 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	PDIA5	Q14554	519 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	CHRNA6	Q15825	494 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	ICE2	Q659A1	982 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	RINL	Q6ZS11	566 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	HTR3D	Q70Z44	454 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	REC114	Q7Z4M0	266 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	TPH2	Q8IWU9	490 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	GOLM1	Q8NBJ4	401 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	LMX1A	Q8TE12	382 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	ALG3	Q92685	438 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	MFSD3	Q96ES6	412 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	DDA1	Q9BW61	102 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	NTM	Q9P121	344 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	CA5B	Q9Y2D0	317 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61	7e-8	■■■■■ 33.2
NAE1-215	ENST00000566336	DYTN	A2CJ06	578 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	CCDC69	A6NI79	296 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	COCH	O43405	550 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	KATNA1	O75449	491 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	CSF2	P04141	144 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	STS	P08842	583 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	CPE	P16870	476 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	GOT1	P17174	413 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	RXRA	P19793	462 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	TACR2	P21452	398 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	MAGEA11	P43364	429 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	NAMPT	P43490	491 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	VAMP7	P51809	220 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	PPP2R5C	Q13362	524 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	MLC1	Q15049	377 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	EPHA7	Q15375	998 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	CST6	Q15828	149 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	FXN	Q16595	210 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	HECTD3	Q5T447	861 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	WSCD1	Q658N2	575 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	USP51	Q70EK9	711 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	DCP2	Q8IU60	420 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	DRC7	Q8IY82	874 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	DYDC2	Q96IM9	177 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	DCLK3	Q9C098	648 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	ACSS2	Q9NR19	701 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	RGL1	Q9NZL6	768 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	GULP1	Q9UBP9	304 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
NAE1-215	ENST00000566336	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	C19orf84	I3L1E1	186 aa		4.96	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms