RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	MARC1	Q5VT66	337 aa		21.89	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		21.89	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		21.89	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	21.89	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	KCTD6	Q8NC69	237 aa		21.89	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		21.89	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		21.89	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		21.89	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	TPP1	O14773	563 aa		21.88	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	21.88	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	MTA2	O94776	668 aa		21.88	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	KRT7	P08729	469 aa		21.88	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	TPM1	P09493	284 aa		21.88	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	JUP	P14923	745 aa		21.88	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	HNF1B	P35680	557 aa		21.88	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	21.88	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	MMP13	P45452	471 aa		21.88	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	MAX	P61244	160 aa		21.88	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	DAB2	P98082	770 aa		21.88	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	21.88	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	21.88	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	SARM1	Q6SZW1	724 aa		21.88	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	PQLC3	Q8N755	202 aa		21.88	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	LMX1A	Q8TE12	382 aa		21.88	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC42	Q96M95	316 aa		21.88	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRC61	Q9BV99	259 aa		21.88	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	USP29	Q9HBJ7	922 aa		21.88	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		21.88	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	21.88	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1W2PQ67	120 aa		21.87	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		21.87	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	RECQL5	O94762	991 aa	Predicted RBP	21.87	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	MYF5	P13349	255 aa		21.87	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	GJC1	P36383	396 aa		21.87	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	E2F1	Q01094	437 aa		21.87	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAF2	Q12933	501 aa		21.87	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	21.87	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	MTM1	Q13496	603 aa		21.87	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	21.87	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	21.87	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	BBS5	Q8N3I7	341 aa		21.87	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		21.87	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		21.87	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	MAML1	Q92585	1016 aa		21.87	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	FATE1	Q969F0	183 aa		21.87	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	APOO	Q9BUR5	198 aa		21.87	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	SPAST	Q9UBP0	616 aa		21.87	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		21.87	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	OR1A2	Q9Y585	309 aa		21.87	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	RP1	P56715	2156 aa		21.87	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	GP1BA	P07359	652 aa		21.86	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	ELFN1	P0C7U0	828 aa		21.86	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	PPARD	Q03181	441 aa		21.86	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	NFATC4	Q14934	902 aa		21.86	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	DEFB133	Q30KQ1	61 aa		21.86	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	PRRT3	Q5FWE3	981 aa		21.86	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		21.86	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		21.86	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	CNGA4	Q8IV77	575 aa		21.86	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		21.86	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		21.86	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	RAPGEF5	Q92565	580 aa		21.86	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	TSGA13	Q96PP4	275 aa		21.86	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	CLPB	Q9H078	707 aa		21.86	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		21.86	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200		A8MX80	341 aa		21.85	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	LMO7DN	F2Z398	122 aa		21.85	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	MAP3K6	O95382	1288 aa		21.85	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	KDELR1	P24390	212 aa		21.85	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	ARHGAP25	P42331	645 aa		21.85	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	HK3	P52790	923 aa		21.85	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	GBE1	Q04446	702 aa		21.85	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	CYP4F3	Q08477	520 aa		21.85	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	21.85	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	IHH	Q14623	411 aa		21.85	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	MESD	Q14696	234 aa		21.85	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	TCEAL1	Q15170	157 aa		21.85	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	ALG11	Q2TAA5	492 aa		21.85	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	BOC	Q9BWV1	1114 aa		21.85	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		21.85	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		21.85	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	21.84	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	MATN3	O15232	486 aa		21.84	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	PGLS	O95336	258 aa		21.84	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	PCCB	P05166	539 aa		21.84	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	TSHR	P16473	764 aa		21.84	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	CCNC	P24863	283 aa		21.84	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIM23	P36406	574 aa		21.84	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	C1orf61	Q13536	156 aa		21.84	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	CNGA3	Q16281	694 aa		21.84	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	21.84	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	FAXC	Q5TGI0	409 aa		21.84	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	KCTD16	Q68DU8	428 aa		21.84	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		21.84	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	21.84	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	21.84	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	COQ10A	Q96MF6	247 aa		21.84	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF157	Q96PX1	679 aa		21.84	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	21.84	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	IL12RB2	Q99665	862 aa		21.84	■■□□□ 1.09

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