RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559850.5

RABGGTA-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 534 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-211ENST00000559850 FFAR2O15552 330 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 CST8O60676 142 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 SOCS5O75159 536 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 NEBLO76041 1014 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 PGLSO95336 258 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 ELFN1P0C7U0 828 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 RABIFP47224 123 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 PFN3P60673 137 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 TAZQ16635 292 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 LIPIQ6XZB0 460 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 TSPAN33Q86UF1 283 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 ZSCAN30Q86W11 494 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 KATNAL2Q8IYT4 538 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 OXR1Q8N573 874 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 CNTD1Q8N815 330 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 PLA2G15Q8NCC3 412 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 DENND6BQ8NEG7 585 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 ARRDC2Q8TBH0 407 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 OLFM3Q96PB7 478 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 HERPUD2Q9BSE4 406 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 HEMGNQ9BXL5 484 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 GPR27Q9NS67 375 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 TOR4AQ9NXH8 423 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 FTSJ1Q9UET6 329 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 KLF15Q9UIH9 416 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 MACROD2A1Z1Q3 448 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 GRID2IPA4D2P6 1211 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 SCAMP1O15126 338 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 PJA2O43164 708 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 LHCGRP22888 699 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 DNAJC3Q13217 504 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 LRRC14Q15048 493 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 ACOX1Q15067 660 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 TCEA2Q15560 299 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 CNGA3Q16281 694 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 ARMC12Q5T9G4 340 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 AADACL2Q6P093 401 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 VSIG1Q86XK7 387 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 RBFAQ8N0V3 343 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 PELI3Q8N2H9 469 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 SLC25A45Q8N413 288 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 PIH1D2Q8WWB5 315 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 IL12RB2Q99665 862 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 KLK13Q9UKR3 277 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 WASF3Q9UPY6 502 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 CHKBQ9Y259 395 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 OR1A2Q9Y585 309 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 TRIM38O00635 465 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 YKT6O15498 198 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 FZD6O60353 706 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 PIAS2O75928 621 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 MMP2P08253 660 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 MYF5P13349 255 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 DGKAP23743 735 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 VIPR1P32241 457 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 CD86P42081 329 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 THOP1P52888 689 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 INPP5AQ14642 412 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 PDK1Q15118 436 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 INAVAQ3KP66 663 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 KCTD16Q68DU8 428 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 RFLNAQ6ZTI6 216 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 GLRX5Q86SX6 157 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 MARCH9Q86YJ5 346 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 FATE1Q969F0 183 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 AGAP3Q96P47 875 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 CDC6Q99741 560 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 SCNM1Q9BWG6 230 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 BRD8Q9H0E9 1235 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 PHTF1Q9UMS5 762 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa14.88□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 BTNL10A8MVZ5 291 aa14.88□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 F5H423 210 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 K7ESM1 405 aa14.88□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 ENC1O14682 589 aa14.88□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 TNFSF14O43557 240 aa14.88□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 GIMD1P0DJR0 217 aa14.88□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 HNF1BP35680 557 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms