RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555806.5

NEDD1-208, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 4

Gene NEDD1, Length 565 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-208ENST00000555806 IL12RB2Q99665 862 aa18.5■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 B4GALT6Q9UBX8 382 aa18.5■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa18.5■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 TRABD2BA6NFA1 517 aa18.49■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
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NEDD1-208ENST00000555806 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
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NEDD1-208ENST00000555806 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
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NEDD1-208ENST00000555806 RHOT2Q8IXI1 618 aa18.49■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
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NEDD1-208ENST00000555806 LRRD1A4D1F6 860 aa18.48■□□□□ 0.55
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NEDD1-208ENST00000555806 E2F1Q01094 437 aa18.48■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 CAMK2BQ13554 666 aa18.48■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 ARMC12Q5T9G4 340 aa18.48■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 RD3Q7Z3Z2 195 aa18.48■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP18.48■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 TEX26Q8N6G2 289 aa18.48■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 FAM181AQ8N9Y4 354 aa18.48■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 ATL2Q8NHH9 583 aa18.48■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 RFFLQ8WZ73 363 aa18.48■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 RAPGEF5Q92565 580 aa18.48■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 FAF2Q96CS3 445 aa18.48■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 SEMA3CQ99985 751 aa18.48■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 USP29Q9HBJ7 922 aa18.48■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 PHTF1Q9UMS5 762 aa18.48■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 TAF4O00268 1085 aa18.47■□□□□ 0.55
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NEDD1-208ENST00000555806 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 CTSEP14091 401 aa18.47■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 MX2P20592 715 aa18.47■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 VIPR1P32241 457 aa18.47■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 ARHGAP25P42331 645 aa18.47■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 GBE1Q04446 702 aa18.47■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 CYP4F3Q08477 520 aa18.47■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP18.47■□□□□ 0.551e-7■■■■□ 24.6
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NEDD1-208ENST00000555806 ODF2Q5BJF6 829 aa18.47■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 DENND2CQ68D51 928 aa18.47■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 PQLC3Q8N755 202 aa18.47■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 PLA2G15Q8NCC3 412 aa18.47■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 LRRN4Q8WUT4 740 aa18.47■□□□□ 0.55
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NEDD1-208ENST00000555806 WDR92Q96MX6 357 aa18.47■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 HAUS2Q9NVX0 235 aa18.47■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 KLQ9UEF7 1012 aa18.47■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 DOLKQ9UPQ8 538 aa18.47■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 CLCA2Q9UQC9 943 aa18.47■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 RAI2Q9Y5P3 530 aa18.47■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa18.46■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 TPP1O14773 563 aa18.46■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 MATN3O15232 486 aa18.46■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 MTA2O94776 668 aa18.46■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 RASGRP1O95267 797 aa18.46■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 PGLSO95336 258 aa18.46■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 TNNT1P13805 278 aa18.46■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 TSHRP16473 764 aa18.46■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 CCNCP24863 283 aa18.46■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 HK3P52790 923 aa18.46■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 CNGA3Q16281 694 aa18.46■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 CDKN3Q16667 212 aa18.46■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 ALG11Q2TAA5 492 aa18.46■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 USP45Q70EL2 814 aa18.46■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 CCNYQ8ND76 341 aa18.46■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 IFI44Q8TCB0 444 aa18.46■□□□□ 0.55
NEDD1-208ENST00000555806 SPOCK2Q92563 424 aa18.46■□□□□ 0.55
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