RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 IL6P05231 212 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 PAEPP09466 180 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 ARP10275 920 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 PDGFRAP16234 1089 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 EN2P19622 333 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 TSPAN5P62079 268 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 SEC23AQ15436 765 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 PERM1Q5SV97 790 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 TREML2Q5T2D2 321 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 MAMSTRQ6ZN01 415 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 PSMB7Q99436 277 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 OSBPL2Q9H1P3 480 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 WDCPQ9H6R7 721 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 WASH6PQ9NQA3 447 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 SDHAF3Q9NRP4 125 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 TRPS1Q9UHF7 1281 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF112Q9UJU3 913 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 H7C1Q1 480 aa6.34□□□□□ -1.4
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PTPRB-210ENST00000551525 G0S2P27469 103 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 HTR1BP28222 390 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CCR1P32246 355 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PIK3CGP48736 1102 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 FMO5P49326 533 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 TLE2Q04725 743 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 GLO1Q04760 184 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 TIGD2Q4W5G0 525 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ANO7Q6IWH7 933 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 NEPROQ6NW34 567 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CFAP161Q6P656 301 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 KBTBD6Q86V97 674 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 SLC15A3Q8IY34 581 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ZBED8Q8IZ13 594 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 LNX2Q8N448 690 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 OR5J2Q8NH18 312 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 GSDMCQ9BYG8 508 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 GPR63Q9BZJ6 419 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 IL23AQ9NPF7 189 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 KLHL11Q9NVR0 708 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 FANCLQ9NW38 375 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 AURKCQ9UQB9 309 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 HEY1Q9Y5J3 304 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PRSS47A8MTI9 375 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PRKD3O94806 890 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 LYPLA2O95372 231 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CHN1P15882 459 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 AKAP5P24588 427 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 RBL1P28749 1068 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 GNALP38405 381 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 GRM5P41594 1212 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 FNTBP49356 437 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ERVK-8P63133 956 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 FGL2Q14314 439 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 GRB14Q14449 540 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PDK3Q15120 406 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 VSTM1Q6UX27 236 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 MOB2Q70IA6 237 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 SYTL1Q8IYJ3 562 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 LRRC52Q8N7C0 313 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 OR8H1Q8NGG4 311 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 RELTQ969Z4 430 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 LENG9Q96B70 501 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 TBC1D20Q96BZ9 403 aa6.33□□□□□ -1.4
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PTPRB-210ENST00000551525 ERLEC1Q96DZ1 483 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 NSL1Q96IY1 281 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 KLK14Q9P0G3 267 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 DNMT3LQ9UJW3 386 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 VPS28Q9UK41 221 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 FBXO10Q9UK96 956 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CLCA2Q9UQC9 943 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PLIN4Q96Q06 1357 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1B0GVG6 124 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 TBC1D3BA6NDS4 549 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 NDUFS8O00217 210 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 MAN2B1O00754 1011 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 TGM6O95932 706 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 IFI30P13284 250 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 FUT4P22083 530 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 MAPK1P28482 360 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 GRK3P35626 688 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 TM4SF4P48230 202 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 SARSP49591 514 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
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