RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535976.1

CLIP1-AS1-201, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CLIP1-AS1, Length 1,745 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ALFQ53S48 1182 aa5.71□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC45A4Q5BKX6 768 aa5.71□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SPDYCQ5MJ68 293 aa5.71□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SNAP47Q5SQN1 464 aa5.71□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HHATQ5VTY9 493 aa5.71□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FBXL22Q6P050 247 aa5.71□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ERAP2Q6P179 960 aa5.71□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa5.71□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HTR3DQ70Z44 454 aa5.71□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CCDC80Q76M96 950 aa5.71□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CHST9Q7L1S5 443 aa5.71□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GPR149Q86SP6 731 aa5.71□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM150AQ86TG1 271 aa5.71□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 YAF2Q8IY57 180 aa5.71□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ALLCQ8N6M5 410 aa5.71□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TEX9Q8N6V9 391 aa5.71□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARL10Q8N8L6 244 aa5.71□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SH3RF2Q8TEC5 729 aa5.71□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DDI1Q8WTU0 396 aa5.71□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ANKRD49Q8WVL7 239 aa5.71□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ING5Q8WYH8 240 aa5.71□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLCO2A1Q92959 643 aa5.71□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OTUB2Q96DC9 234 aa5.71□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TCEAL4Q96EI5 215 aa5.71□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SNF8Q96H20 258 aa5.71□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CLUHP3Q96NS8 147 aa5.71□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa5.71□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM118BQ9BPY3 351 aa5.71□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM121Q9BTD3 319 aa5.71□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC46A2Q9BY10 475 aa5.71□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PARD6BQ9BYG5 372 aa5.71□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MAGEB5Q9BZ81 275 aa5.71□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRIM8Q9BZR9 551 aa5.71□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRIM31Q9BZY9 425 aa5.71□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF700Q9H0M5 742 aa5.71□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DPH5Q9H2P9 285 aa5.71□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SP110Q9HB58 689 aa5.71□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PCDH9Q9HC56 1237 aa5.71□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM248Q9NWD8 314 aa5.71□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa5.71□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GDE1Q9NZC3 331 aa5.71□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DTLQ9NZJ0 730 aa5.71□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NR2E1Q9Y466 385 aa5.71□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa5.71□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa5.71□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A0A1B0GVM2 712 aa5.71□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TCAF2A6NFQ2 919 aa5.71□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PSMD3O43242 534 aa5.71□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MFSD11O43934 449 aa5.71□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RAMP2O60895 175 aa5.71□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TGFB1P01137 390 aa5.71□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RHOCP08134 193 aa5.71□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CEBPBP17676 345 aa5.71□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RBL1P28749 1068 aa5.71□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IFNAR2P48551 515 aa5.71□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DRG2P55039 364 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NTHL1P78549 312 aa5.71□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GBE1Q04446 702 aa5.71□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GPS1Q13098 491 aa5.71□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CDH18Q13634 790 aa5.71□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TCEA2Q15560 299 aa5.71□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OASLQ15646 514 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 P3H1Q32P28 736 aa5.71□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PARP15Q460N3 678 aa5.71□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MANEALQ5VSG8 457 aa5.71□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FBXW10Q5XX13 1052 aa5.71□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IL31Q6EBC2 164 aa5.71□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa5.71□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PPP4R4Q6NUP7 873 aa5.71□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 WDR93Q6P2C0 686 aa5.71□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TTC27Q6P3X3 843 aa5.71□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RFWD3Q6PCD5 774 aa5.71□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa5.71□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa5.71□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa5.71□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CCDC13Q8IYE1 715 aa5.71□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CPXM2Q8N436 756 aa5.71□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CARNMT1Q8N4J0 409 aa5.71□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FBXL6Q8N531 539 aa5.71□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP5.71□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM71DQ8N9W8 422 aa5.71□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LRRN4CLQ8ND94 238 aa5.71□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.1 ms