RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534284.1

CYCSP28-201, Transcript of cytochrome c, somatic pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene CYCSP28, Length 321 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYCSP28-201ENST00000534284 IGDCC3Q8IVU1 814 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 BRSK2Q8IWQ3 736 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 YAF2Q8IY57 180 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 THNSL1Q8IYQ7 743 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 ARHGAP24Q8N264 748 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 GALNT15Q8N3T1 639 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 ALLCQ8N6M5 410 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 NAXEQ8NCW5 288 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 IL17RDQ8NFM7 739 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 OR14K1Q8NGZ2 314 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 LRRC8CQ8TDW0 803 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 TCP11Q8WWU5 503 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 MAML1Q92585 1016 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 SAAL1Q96ER3 474 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 UBXN10Q96LJ8 280 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 LRRC37BQ96QE4 947 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 TAAR1Q96RJ0 339 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 FAM213AQ9BRX8 229 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 MSTO1Q9BUK6 570 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 TEX13BQ9BXU2 312 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 PITPNM3Q9BZ71 974 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 DNAI2Q9GZS0 605 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 TMEM168Q9H0V1 697 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 LHX5Q9H2C1 402 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 SLC6A15Q9H2J7 730 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 ACAD9Q9H845 621 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 ECT2Q9H8V3 914 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 EBF2Q9HAK2 575 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 SMURF2Q9HAU4 748 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 NOD2Q9HC29 1040 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 ARHGEF3Q9NR81 526 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 FBXO28Q9NVF7 368 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 HOXC10Q9NYD6 342 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 ZNF148Q9UQR1 794 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 SMCHD1A6NHR9 2005 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 WDR81Q562E7 1941 aa4.82□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 DOCK1Q14185 1865 aa4.82□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 CLUHO75153 1309 aa4.82□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 SIP14410 1827 aa4.82□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa4.82□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa4.82□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa4.82□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 TMEM191CA6NGB0 347 aa4.82□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 AQP12BA6NM10 295 aa4.82□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 VGLL3A8MV65 326 aa4.82□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 ZNF487B1APH4 448 aa4.82□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 TMEM233B4DJY2 109 aa4.82□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 TISP43B9A030 160 aa4.82□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 SYT5O00445 386 aa4.82□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 PIP5K1BO14986 540 aa4.82□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 AREL1O15033 823 aa4.82□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 OGTO15294 1046 aa4.82□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 TP73O15350 636 aa4.82□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 NCAM2O15394 837 aa4.82□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 TOM1L1O75674 476 aa4.82□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 FAM155BO75949 473 aa4.82□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 ASS1P00966 412 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 TNNC2P02585 160 aa4.82□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 KRT1P04264 644 aa4.82□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 GRPP07492 148 aa4.82□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 TMEM191BP0C7N4 346 aa4.82□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 ACO1P21399 889 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 STIP1P31948 543 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 ARL2P36404 184 aa4.82□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 CASP2P42575 452 aa4.82□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 SSR1P43307 286 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 SLCO1A2P46721 670 aa4.82□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 KCNJ1P48048 391 aa4.82□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 IFNAR2P48551 515 aa4.82□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 GZMKP49863 264 aa4.82□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 SLC26A2P50443 739 aa4.82□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 UCP3P55916 312 aa4.82□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 ACTR2P61160 394 aa4.82□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 NCALDP61601 193 aa4.82□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 CDK18Q07002 472 aa4.82□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 SPP2Q13103 211 aa4.82□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 TRPC3Q13507 836 aa4.82□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 SNX1Q13596 522 aa4.82□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 TFDP1Q14186 410 aa4.82□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 TFDP2Q14188 446 aa4.82□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 MAPK6Q16659 721 aa4.82□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 KYNUQ16719 465 aa4.82□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 UGCGQ16739 394 aa4.82□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 P3H1Q32P28 736 aa4.82□□□□□ -1.64
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