RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533198.1

DDX10-205, Transcript of DEAD-box helicase 10, human

TSL 3

Gene DDX10, Length 372 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX10-205	ENST00000533198	CIITA	P33076	1130 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	SHMT1	P34896	483 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	SUOX	P51687	545 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	PLIN5	Q00G26	463 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	TFCP2	Q12800	502 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	NAB2	Q15742	525 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	PMS2CL	Q68D20	193 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	LCTL	Q6UWM7	567 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	SGCD	Q92629	289 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	RMDN1	Q96DB5	314 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	TMEM68	Q96MH6	324 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	GAD1	Q99259	594 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	HRH4	Q9H3N8	390 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	FLT1	P17948	1338 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	HSPB2	A8KAH6	182 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	MGST3	O14880	152 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	DIAPH2	O60879	1101 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	NEURL1	O76050	574 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	JTB	O76095	146 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	TMCC1	O94876	653 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	PLAU	P00749	431 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	MYBL1	P10243	752 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	SRD5A1	P18405	259 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	TACR3	P29371	465 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	AVPR1B	P47901	424 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	CENPA	P49450	140 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	YPEL5	P62699	121 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	DDR1	Q08345	913 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	CAMK2D	Q13557	499 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	GRAP	Q13588	217 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	PKP1	Q13835	747 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	PGM5	Q15124	567 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	HSPB2	Q16082	182 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	KRT80	Q6KB66	452 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	CES5A	Q6NT32	575 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	IQCA1	Q86XH1	822 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	RITA1	Q96K30	269 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	GPATCH1	Q9BRR8	931 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	CMAHP	Q9Y471	501 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	SMIM22	K7EJ46	135 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	EBAG9	O00559	213 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	INPPL1	O15357	1258 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	SLC7A4	O43246	635 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	ATP2C2	O75185	946 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	AVIL	O75366	819 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	C22orf31	O95567	290 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	WNT1	P04628	370 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	CD63	P08962	238 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	CTPS1	P17812	591 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	PTGER1	P34995	402 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	MSH2	P43246	934 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	CXCR3	P49682	368 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	CLCNKB	P51801	687 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	PNLIPRP2	P54317	469 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	CDON	Q4KMG0	1287 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	SGO1	Q5FBB7	561 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DDX10-205	ENST00000533198	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		4.63	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.4 ms