RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530164.5

RPS3-214, Transcript of ribosomal protein S3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS3, Length 1,878 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3-214ENST00000530164 ZZEF1O43149 2961 aa9.6□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 SLCO1B7G3V0H7 640 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 H3BNX3 289 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 DAB1O75553 588 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 RECQL4O94761 1208 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 ABLIM3O94929 683 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 LRG1P02750 347 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 CAPNS1P04632 268 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 THRAP10827 490 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 VCLP18206 1134 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 MGAT1P26572 445 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 TYK2P29597 1187 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 AIF1P55008 147 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 POLE2P56282 527 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 SHC2P98077 582 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 CREB5Q02930 508 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 LSAMPQ13449 338 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 CAMK2BQ13554 666 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 SFT2D3Q587I9 215 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 PRSS36Q5K4E3 855 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 IL31Q6EBC2 164 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 SLC8B1Q6J4K2 584 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 RNF111Q6ZNA4 994 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 RFX8Q6ZV50 586 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 CRYBG2Q8N1P7 616 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 BRD8Q9H0E9 1235 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 LRRC40Q9H9A6 602 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 MRGBPQ9NV56 204 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 PNPOQ9NVS9 261 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 HACD3Q9P035 362 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 TMEM216Q9P0N5 145 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 SPEGQ15772 3267 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 CITO14578 2027 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 CEP295Q9C0D2 2601 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 MAGEB16A2A368 324 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 AP3B1O00203 1094 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 RNF103O00237 685 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 PRRG1O14668 218 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 TIMM44O43615 452 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 PMLP29590 882 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 GDI1P31150 447 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 GRIA1P42261 906 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 HSPA13P48723 471 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 CSRP3P50461 194 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 CHN2P52757 468 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 LIMK1P53667 647 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 GAS6Q14393 721 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 RALGPS1Q5JS13 557 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 SH2D4BQ5SQS7 431 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 UGT2A3Q6UWM9 527 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 DEFB107AQ8IZN7 70 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 SLC26A7Q8TE54 656 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 DLG3Q92796 817 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 SMARCD2Q92925 531 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 CORO1BQ9BR76 489 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 SNX15Q9NRS6 342 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 SYBUQ9NX95 663 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 VTI1BQ9UEU0 232 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 RAB26Q9ULW5 256 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 TRIP11Q15643 1979 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
RPS3-214ENST00000530164 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa9.58□□□□□ -0.88
RPS3-214ENST00000530164 G3V2L1 256 aa9.58□□□□□ -0.88
RPS3-214ENST00000530164 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
RPS3-214ENST00000530164 TM4SF5O14894 197 aa9.58□□□□□ -0.88
RPS3-214ENST00000530164 MTSS1O43312 755 aa9.58□□□□□ -0.88
RPS3-214ENST00000530164 TRIM13O60858 407 aa9.58□□□□□ -0.88
RPS3-214ENST00000530164 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
RPS3-214ENST00000530164 PENKP01210 267 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
RPS3-214ENST00000530164 ZCCHC18P0CG32 403 aa9.58□□□□□ -0.88
RPS3-214ENST00000530164 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
RPS3-214ENST00000530164 TKTP29401 623 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
RPS3-214ENST00000530164 ARRB2P32121 409 aa9.58□□□□□ -0.88
RPS3-214ENST00000530164 MATKP42679 507 aa9.58□□□□□ -0.88
RPS3-214ENST00000530164 POLD2P49005 469 aa9.58□□□□□ -0.88
RPS3-214ENST00000530164 FNTBP49356 437 aa9.58□□□□□ -0.88
RPS3-214ENST00000530164 CLCNKBP51801 687 aa9.58□□□□□ -0.88
RPS3-214ENST00000530164 RPS6KA3P51812 740 aa9.58□□□□□ -0.88
RPS3-214ENST00000530164 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
RPS3-214ENST00000530164 PDK3Q15120 406 aa9.58□□□□□ -0.88
RPS3-214ENST00000530164 ZBTB6Q15916 424 aa9.58□□□□□ -0.88
RPS3-214ENST00000530164 UPP1Q16831 310 aa9.58□□□□□ -0.88
RPS3-214ENST00000530164 SLC25A52Q3SY17 297 aa9.58□□□□□ -0.88
RPS3-214ENST00000530164 CFAP157Q5JU67 520 aa9.58□□□□□ -0.88
RPS3-214ENST00000530164 CASC4Q6P4E1 433 aa9.58□□□□□ -0.88
RPS3-214ENST00000530164 CD300LGQ6UXG3 332 aa9.58□□□□□ -0.88
RPS3-214ENST00000530164 VITQ6UXI7 678 aa9.58□□□□□ -0.88
RPS3-214ENST00000530164 DPH6Q7L8W6 267 aa9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms