RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519057.5

COPS5-208, Transcript of COP9 signalosome subunit 5, human

TSL 4

Gene COPS5, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS5-208	ENST00000519057	ZFP57	Q9NU63	452 aa		4.38	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	TINAG	Q9UJW2	476 aa		4.38	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		4.38	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF711	Q9Y462	761 aa		4.38	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057		A0A0G2JPF8	293 aa		4.37	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		4.37	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	P2RY10	O00398	339 aa		4.37	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	CFC1B	P0CG36	223 aa		4.37	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	CFC1	P0CG37	223 aa		4.37	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		4.37	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	PCNA	P12004	261 aa		4.37	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	SLC2A4	P14672	509 aa		4.37	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	MCM3	P25205	808 aa		4.37	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	EFR3A	Q14156	821 aa		4.37	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	MMEL1	Q495T6	779 aa		4.37	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		4.37	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		4.37	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		4.37	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	SFR1	Q86XK3	245 aa		4.37	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		4.37	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		4.37	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		4.37	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	TMEM19	Q96HH6	336 aa		4.37	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	TTC14	Q96N46	770 aa		4.37	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	CD180	Q99467	661 aa		4.37	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	EYA3	Q99504	573 aa		4.37	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	REEP2	Q9BRK0	252 aa		4.37	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	HAUS8	Q9BT25	410 aa		4.37	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		4.37	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		4.37	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		4.37	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	VDAC3	Q9Y277	283 aa		4.37	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	PSAT1	Q9Y617	370 aa		4.37	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	FAM172BP	A6NC97	362 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	IRAK2	O43187	625 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	CRYAA	P02489	173 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	HLA-DOB	P13765	273 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	MARK3	P27448	753 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	STX2	P32856	288 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	ARL4C	P56559	192 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	RHBDL3	P58872	404 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	PMS2CL	Q68D20	193 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	WDR73	Q6P4I2	378 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	MTSS1L	Q765P7	747 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	PLD5	Q8N7P1	536 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	RND1	Q92730	232 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	KLHL1	Q9NR64	748 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	PEMT	Q9UBM1	199 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	WDR81	Q562E7	1941 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	TIPRL	O75663	272 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	AGA	P20933	346 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	EFNA5	P52803	228 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	SLC20A2	Q08357	652 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	GRIK3	Q13003	919 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	ELP4	Q96EB1	424 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	WBP1	Q96G27	269 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	NUF2	Q9BZD4	464 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	CSTL1	Q9H114	145 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	GAB2	Q9UQC2	676 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	TSPAN3	O60637	253 aa		4.34	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	ETFA	P13804	333 aa		4.34	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	CD58	P19256	250 aa		4.34	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	KCNA5	P22460	613 aa		4.34	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	CLCN3	P51790	818 aa		4.34	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	KRTAP10-12	P60413	245 aa		4.34	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	SGO1	Q5FBB7	561 aa		4.34	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		4.34	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		4.34	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		4.34	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		4.34	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		4.34	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		4.34	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		4.34	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		4.34	□□□□□ -1.71
COPS5-208	ENST00000519057	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		4.34	□□□□□ -1.71

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