RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512656.1

USP46-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

TSL 3

Gene USP46, Length 467 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-208ENST00000512656 Q6ZSR6 202 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 FAM131BQ86XD5 332 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 DRC7Q8IY82 874 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 LSMEM2Q8N112 164 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 OR7D4Q8NG98 312 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 ARHGEF26Q96DR7 871 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 CFAP57Q96MR6 1250 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 DEPDC7Q96QD5 511 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 TCF12Q99081 682 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 SLC17A9Q9BYT1 436 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 ABCG4Q9H172 646 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 OSBPL2Q9H1P3 480 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 LIN7BQ9HAP6 207 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 ANLNQ9NQW6 1124 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 DNAJC28Q9NX36 388 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 CHMP5Q9NZZ3 219 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 OR12D3Q9UGF7 316 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 TMEM59LQ9UK28 342 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 CA5BQ9Y2D0 317 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 SNX10Q9Y5X0 201 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 FHOD1Q9Y613 1164 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 MGAQ8IWI9 3026 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 ANKRD62A6NC57 917 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 F8VZ95 297 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 I6L893 689 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 FPGTO14772 594 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 SCAMP1O15126 338 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 NDUFB5O43674 189 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 OPA1O60313 960 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 BRINP1O60477 761 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 POP4O95707 220 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 GSRP00390 522 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 CSF2P04141 144 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 MMEP08473 750 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 NME1P15531 152 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 MMP8P22894 467 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 ADRA1BP35368 520 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 CLDN6P56747 220 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 CLDN2P57739 230 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 NOMO3P69849 1222 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 CDR2Q01850 454 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 PTK2BQ14289 1009 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 DPCR1Q3MIW9 517 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 TCP11X2Q5H9J9 407 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 SEL1L3Q68CR1 1132 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 STRADAQ7RTN6 431 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 TMC6Q7Z403 805 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 BNIPLQ7Z465 357 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 PARGQ86W56 976 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 FAM181AQ8N9Y4 354 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 DENND6BQ8NEG7 585 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 BTN2A2Q8WVV5 523 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 ASB12Q8WXK4 309 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 CPA5Q8WXQ8 436 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 GRAMD1AQ96CP6 724 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 TBC1D31Q96DN5 1066 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 NUP62CLQ9H1M0 184 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 MAGEH1Q9H213 219 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 FZD3Q9NPG1 666 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 TMEM248Q9NWD8 314 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 UCKL1Q9NWZ5 548 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 ZNF212Q9UDV6 495 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 FADS3Q9Y5Q0 445 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 POM121BA6NF01 834 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 IGLON5A6NGN9 336 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 C16orf96A6NNT2 1141 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 K7ESM1 405 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 KRIT1O00522 736 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 TOR1BO14657 336 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 AQP9O43315 295 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms