RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 KCNA5P22460 613 aa2.32□□□□□ -2.04
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PDE4D-218ENST00000509368 CENPAP49450 140 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 EVCP57679 992 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 STX1BP61266 288 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 HSD11B2P80365 405 aa2.32□□□□□ -2.04
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PDE4D-218ENST00000509368 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
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PDE4D-218ENST00000509368 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 ACSM2BQ68CK6 577 aa2.32□□□□□ -2.04
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PDE4D-218ENST00000509368 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
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PDE4D-218ENST00000509368 ZNF619Q8N2I2 560 aa2.32□□□□□ -2.04
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PDE4D-218ENST00000509368 PLD5Q8N7P1 536 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 FIBINQ8TAL6 211 aa2.32□□□□□ -2.04
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PDE4D-218ENST00000509368 CLEC4CQ8WTT0 213 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 ATL1Q8WXF7 558 aa2.32□□□□□ -2.04
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PDE4D-218ENST00000509368 CCDC144AA2RUR9 1427 aa2.31□□□□□ -2.04
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PDE4D-218ENST00000509368 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
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PDE4D-218ENST00000509368 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa2.31□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 OR10S1Q8NGN2 331 aa2.31□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 HDAC7Q8WUI4 952 aa2.31□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP2.31□□□□□ -2.04
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PDE4D-218ENST00000509368 FAM89AQ96GI7 184 aa2.31□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa2.31□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 SPXQ9BT56 116 aa2.31□□□□□ -2.04
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