RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR27	Q9NS67	375 aa		11	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		11	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		11	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	LMO7DN	F2Z398	122 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF103	O00237	685 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	CASC3	O15234	703 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	YY2	O15391	372 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	TSPAN6	O43657	245 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	HSF2BP	O75031	334 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	GCAT	O75600	419 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	CNTN5	O94779	1100 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	CTSE	P14091	401 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	TSHR	P16473	764 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	GNA15	P30679	374 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	PRCP	P42785	496 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	PDX1	P52945	283 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	KRT85	P78386	507 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	PPARD	Q03181	441 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	PDCL	Q13371	301 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	TBR1	Q16650	682 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	PARS2	Q7L3T8	475 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM110	Q86TL2	294 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	VPS36	Q86VN1	386 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	ARL10	Q8N8L6	244 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	PSMB7	Q99436	277 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	SYNC	Q9H7C4	482 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A0D9SEW6	157 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511		D6RAR5	112 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	AP1G1	O43747	822 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF202	O95125	648 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	GLI1	P08151	1106 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	ALPI	P09923	528 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	ITGB6	P18564	788 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	OR1E1	P30953	314 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	USP8	P40818	1118 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	BLK	P51451	505 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	MAPK10	P53779	464 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	PFN3	P60673	137 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	CYP4F2	P78329	520 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	CCL7	P80098	99 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	GCNT1	Q02742	428 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC63	Q05C16	580 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	STIM1	Q13586	685 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	ELOC	Q15369	112 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	10.98	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	ALF	Q53S48	1182 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	CARD16	Q5EG05	197 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	HSCB	Q8IWL3	235 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	OR7D4	Q8NG98	312 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	SEMA3C	Q99985	751 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	WDCP	Q9H6R7	721 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	ITM2B	Q9Y287	266 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	DOCK9	Q9BZ29	2069 aa		10.97	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		10.97	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		10.97	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	10.97	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	NVL	O15381	856 aa	Known RBP	10.97	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	P4HA2	O15460	535 aa		10.97	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	NOBOX	O60393	691 aa		10.97	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	PRAMEF10	O60809	474 aa		10.97	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	GP1BB	P13224	206 aa		10.97	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	ITIH1	P19827	911 aa		10.97	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	10.97	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	10.97	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	10.97	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	SNX16	P57768	344 aa		10.97	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	YPEL5	P62699	121 aa		10.97	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC20A2	Q08357	652 aa		10.97	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	PNOC	Q13519	176 aa		10.97	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	10.97	□□□□□ -0.65

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